RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC30A7Q8NEW0 376 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR11H7Q8NGC8 314 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR4D9Q8NGE8 314 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR82Q96P67 336 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GBA3Q9H227 469 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HOMER3Q9NSC5 361 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OTOFQ9HC10 1997 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AKAP6Q13023 2319 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MED12Q93074 2177 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCNX1Q96RV3 2341 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LAMC1P11047 1609 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM47DPA6NHR8 397 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF726A6NNF4 738 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A8MUN3 132 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UPK3AO75631 287 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MFN2O95140 757 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BCKDHBP21953 392 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TDO2P48775 406 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CNN1P51911 297 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF138P52744 262 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PKNOX1P55347 436 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SNU13P55769 128 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDK5Q00535 292 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TFCP2Q12800 502 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TIMM23BQ5SRD1 257 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MPP7Q5T2T1 576 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLET1Q6UQ28 207 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PEX26Q7Z412 305 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 VN1R4Q7Z5H5 301 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM17Q86X19 198 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LYPD6Q86Y78 171 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 Q8NAQ8 132 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR10D4PQ8NGN7 298 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR10A4Q9H209 315 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MCCC2Q9HCC0 563 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AIPL1Q9NZN9 384 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TBK1Q9UHD2 729 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SHANK3Q9BYB0 1731 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MUC4Q99102 2169 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CUBNO60494 3623 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A1B0GU33 70 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC182A6NF36 153 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GGTLC3B5MD39 225 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 H0Y626 953 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ERLIN2O94905 339 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OPN1LWP04000 364 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CD3DP04234 171 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF708P17019 499 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PAX7P23759 505 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 COILP38432 576 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR4P46093 362 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR1G1P47890 313 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPBWR2P48146 333 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RFX3P48380 749 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CLDN6P56747 220 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DMC1Q14565 340 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM159AQ6UWV7 190 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM131AQ6UXB0 335 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GBP6Q6ZN66 633 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 Q8N2B8 174 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RAD51AP1Q96B01 352 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC35G5Q96KT7 338 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AMELYQ99218 206 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC6A7Q99884 636 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CHMP4AQ9BY43 222 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NDUFA13Q9P0J0 144 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 P2RX2Q9UBL9 471 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CTNNA3Q9UI47 895 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 JPT1Q9UK76 154 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 COPS3Q9UNS2 423 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SNX5Q9Y5X3 404 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TET1Q8NFU7 2136 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CACNA1SQ13698 1873 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GLI3P10071 1580 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FRMPD4Q14CM0 1322 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PI4KAP42356 2102 aa-1.34□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms