RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	ASRGL1	Q7L266	308 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SSX6	Q7RTT6	188 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SYT12	Q8IV01	421 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR4C6	Q8NH72	309 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXL8	Q96CD0	374 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	NODAL	Q96S42	347 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DPH7	Q9BTV6	452 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CALHM2	Q9HA72	323 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	MED9	Q9NWA0	146 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CLN8	Q9UBY8	286 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	HHLA2	Q9UM44	414 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		6.07	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A087WWL8	130 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FRG2C	A6NGY1	282 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP5D1	E7EU14	171 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP6C	O00743	305 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CYB5B	O43169	146 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	LAT	O43561	262 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RGS14	O43566	566 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	STK16	O75716	305 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM50A	O95807	157 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTL6A	O96019	429 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ISG15	P05161	165 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FOLR1	P15328	257 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	MAK	P20794	623 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ACADL	P28330	430 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	HTR2C	P28335	458 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	IL12A	P29459	219 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	FMO3	P31513	532 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	UQCRC1	P31930	480 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PRDX2	P32119	198 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	GGT2	P36268	569 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DDOST	P39656	456 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CRYBB2	P43320	205 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	EFNA3	P52797	238 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2B8P	P59922	312 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB5B	P61020	215 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF616	Q08AN1	781 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	HSPB3	Q12988	150 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAF3	Q13114	568 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	BTN1A1	Q13410	526 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	GTF2H2	Q13888	395 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DGUOK	Q16854	277 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	SYTL3	Q4VX76	610 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	METRNL	Q641Q3	311 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM42	Q69YG0	159 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	STUM	Q69YW2	141 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	DOK3	Q7L591	496 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB43	Q86YS6	212 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	VRK3	Q8IV63	474 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		6.06	□□□□□ -1.44
FBXO38-208	ENST00000504971	ABHD3	Q8WU67	409 aa		6.06	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms