RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477112.1

DDX17-208, Transcript of DEAD-box helicase 17, human

TSL 2

Gene DDX17, Length 654 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX17-208	ENST00000477112	NAT14	Q8WUY8	206 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	FAM3C	Q92520	227 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	TLCD1	Q96CP7	247 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	YIPF6	Q96EC8	236 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	PELI1	Q96FA3	418 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	MBOAT4	Q96T53	435 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	HBEGF	Q99075	208 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	VAT1	Q99536	393 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	EBF4	Q9BQW3	602 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	LAT2	Q9GZY6	243 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	MMP28	Q9H239	520 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	GAREM1	Q9H706	876 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	GHRL	Q9UBU3	117 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	RAB26	Q9ULW5	256 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	SNX24	Q9Y343	169 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	NME7	Q9Y5B8	376 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		2.55	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ANTXRL	A6NF34	631 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	MYMK	A6NI61	221 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	SHISA7	A6NL88	538 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	OR11H12	B2RN74	326 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	C21orf140	B9A014	251 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	PRSS46	E5RG02	174 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112		F5H768	121 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112		G3V2T6	193 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	SULT1C2	O00338	296 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	CLDN5	O00501	218 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	BHLHE40	O14503	412 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	PRKAB2	O43741	272 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	XPNPEP2	O43895	674 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	PLIN3	O60664	434 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	RAD1	O60671	282 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	DCTN3	O75935	186 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	SCGN	O76038	276 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	GAGE7	O76087	117 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	AP2A2	O94973	939 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	JCHAIN	P01591	159 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ORM1	P02763	201 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ALDOB	P05062	364 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	CSN3	P07498	182 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	GAGE12F	P0CL80	117 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	GAGE12G	P0CL81	117 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	GAGE12I	P0CL82	117 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	MYL2	P10916	166 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ZNF35	P13682	527 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	PAX1	P15863	534 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	SERPINA2	P20848	420 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	FUT3	P21217	361 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	BCKDHB	P21953	392 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	LHCGR	P22888	699 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	SSTR1	P30872	391 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ARRB2	P32121	409 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	CD200	P41217	278 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	BRCC3	P46736	316 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	LHX1	P48742	406 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	TTPA	P49638	278 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	RAB7A	P51149	207 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	CTSC	P53634	463 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ATP1B3	P54709	279 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	BACE1	P56817	501 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	HMGCS1	Q01581	520 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	ACVR1	Q04771	509 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	KLRC3	Q07444	240 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	C2orf80	Q0P641	193 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	GAGE2B	Q13066	116 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	GAGE4	Q13068	117 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	GPR18	Q14330	331 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	PRPSAP1	Q14558	356 aa		2.54	□□□□□ -2
DDX17-208	ENST00000477112	KCNJ11	Q14654	390 aa		2.54	□□□□□ -2

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