RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475470.1

RPUSD3-215, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, human

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 2,413 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD3-215	ENST00000475470	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	CENPX	A8MT69	81 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF878	C9JN71	531 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	WDPCP	O95876	746 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	ITGA3	P26006	1051 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	GDF1	P27539	372 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	HSD11B1	P28845	292 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	CLDN20	P56880	219 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	RAC3	P60763	192 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLC36A2	Q495M3	483 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	DCAF10	Q5QP82	559 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	UTS2B	Q765I0	119 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR2M2	Q96R28	347 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	ABI3	Q9P2A4	366 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	KNTC1	P50748	2209 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	P2RY10	O00398	339 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	DNPH1	O43598	174 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SCAND1	P57086	179 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	CARD18	P57730	90 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SGCA	Q16586	387 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	LUZP2	Q86TE4	346 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	HAVCR1	Q96D42	359 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	FAM117A	Q9C073	453 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	IL17B	Q9UHF5	180 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	PINLYP	A6NC86	204 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLC6A1	P30531	599 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	RAB11B	Q15907	218 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	MTFR2	Q6P444	385 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	TMEM54	Q969K7	222 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	TTLL8	A6PVC2	850 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	FST	P19883	344 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	CSRP2	Q16527	193 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SIAH3	Q8IW03	269 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	UPRT	Q96BW1	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLC17A2	O00624	439 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	RER1	O15258	196 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SULT1B1	O43704	296 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	ORC5	O43913	435 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	TTR	P02766	147 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	ITGA5	P08648	1049 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	GSTT2	P0CG29	244 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	CDK2	P24941	298 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	CFP	P27918	469 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	STAR	P49675	285 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	TATDN3	Q17R31	274 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	GGN	Q86UU5	652 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	NIPAL2	Q9H841	368 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	NCKAP5	O14513	1909 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	TTC28	Q96AY4	2481 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470		A0A0B4J293	547 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	NEURL1	O76050	574 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	ACSM4	P0C7M7	580 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	DDOST	P39656	456 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SELENOP	P49908	381 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	C10orf128	Q5T292	105 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	TMEM123	Q8N131	208 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPUSD3-215	ENST00000475470	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		13.6	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms