RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 SSTR5P35346 364 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 DEFB132Q7Z7B7 95 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 PIFOQ8TCI5 191 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CNDP1Q96KN2 507 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 PKNOX2Q96KN3 472 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 TIMM17AQ99595 171 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 UTRNP46939 3433 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 KDM5CP41229 1560 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 NEURL4Q96JN8 1562 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 STRCP1A6NGW2 1772 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 BPY2O14599 106 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ZNF250P15622 560 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CEACAM3P40198 252 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 PRPHP41219 470 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 PLP1P60201 277 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ZNF616Q08AN1 781 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CDH17Q12864 832 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 NIPA1Q7RTP0 329 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 WDFY1Q8IWB7 410 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ZNF488Q96MN9 340 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 SCAPERQ9BY12 1400 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 NWD1Q149M9 1564 aa3.25□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 DOCK8Q8NF50 2099 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 AGLP35573 1532 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 MROH2AA6NES4 1674 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 A2ML1A8K2U0 1454 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CDC7O00311 574 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 MX1P20591 662 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CRYBB2P43320 205 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 SSR4P51571 173 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 RND2P52198 227 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ACTR1AP61163 376 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 IFT88Q13099 833 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 RCAN2Q14206 197 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 KDELC1Q6UW63 502 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 METTL13Q8N6R0 699 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 RSPH1Q8WYR4 309 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 NTAN1Q96AB6 310 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 IQGAP1P46940 1657 aa3.24□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ATP10BO94823 1461 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 LGALS9O00182 355 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 IGHDP01880 384 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CASP14P31944 242 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 PRMT2P55345 433 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 SLC39A6Q13433 755 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 FGD6Q6ZV73 1430 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 LIX1Q8N485 282 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 LRRC52Q8N7C0 313 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 LILRB4Q8NHJ6 448 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 SLC7A13Q8TCU3 470 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CRACR2AQ9BSW2 395 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 OR52D1Q9H346 318 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 LRRC40Q9H9A6 602 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 UGGT2Q9NYU1 1516 aa3.23□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CLPXO76031 633 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 PRRX1P54821 245 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 B3GNT7Q8NFL0 401 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 OR5B3Q8NH48 314 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 NUP50Q9UKX7 468 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 SHPRHQ149N8 1683 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 BCL9LQ86UU0 1499 aa3.22□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa3.21□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa3.21□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ITSN2Q9NZM3 1697 aa3.21□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 ABCC1P33527 1531 aa3.21□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 KDM5DQ9BY66 1539 aa3.21□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa3.21□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa3.21□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 C5orf63A6NC05 138 aa3.21□□□□□ -1.9
SGCE-210ENST00000472326 L7N2F9 121 aa3.21□□□□□ -1.9
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