RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 TRANK1O15050 2925 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 A0A0G2JMP0 313 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CD1EP15812 388 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 LHX2P50458 406 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 OR8B8Q15620 311 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 FADS6Q8N9I5 356 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF511Q8NB15 262 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 S100PBPQ96BU1 408 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 MOGAT1Q96PD6 335 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 GAL3ST1Q99999 423 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 PRSS50Q9UI38 385 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.21□□□□□ -1.09
DDX39B-215ENST00000462256 OR6C6A6NF89 314 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 SLC2A10O95528 541 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 CAPNS1P04632 268 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 PRKCDQ05655 676 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 FOXO1Q12778 655 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 CDK10Q15131 360 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 HFEQ30201 348 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZT83 130 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 GPR32P1Q8NGA4 272 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 THRSPQ92748 146 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 RAB1CQ92928 201 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 BORCS8Q96FH0 119 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 MED13LQ71F56 2210 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 SPRY3O43610 288 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 CYTIPO60759 359 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 HPRP00739 348 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 GASTP01350 101 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 EPXP11678 715 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 HNF1AP20823 631 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 PCMT1P22061 227 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 AGTR1P30556 359 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 OR3A2P47893 321 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 MTNR1AP48039 350 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ASB17Q8WXJ9 295 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 GPR35Q9HC97 309 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 RGS10O43665 173 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 CLIC3O95833 236 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 HTR2BP41595 481 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 SOX2P48431 317 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 CLDN18P56856 261 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ACTA2P62736 377 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ACTG2P63267 376 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 OR8G1Q15617 311 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 OR5H1A6NKK0 313 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 CDC14BO60729 498 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM11P17152 192 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 IL11P20809 199 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 CDAP32320 146 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 CAPGP40121 348 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 MAP2K3P46734 347 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 MCHR2Q969V1 340 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 H0YAE9 185 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 M0R135 149 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF32P17041 273 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 GABRA2P47869 451 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ALKBH6Q3KRA9 238 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM81Q6P7N7 255 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 SLC35F2Q8IXU6 374 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF799Q96GE5 643 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.2□□□□□ -1.1
DDX39B-215ENST00000462256 ATF6BQ99941 703 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms