RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 H7C1Q1 480 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 LHX8Q68G74 356 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 OPALINQ96PE5 141 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 OPRM1P35372 400 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 RNF141Q8WVD5 230 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 OR6C76A6NM76 312 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 H0YIG0 161 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 OR13C7P0DN81 318 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 RPL34P49207 117 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 ADIRFQ15847 76 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 TCTN3Q6NUS6 607 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 CATSPERDQ86XM0 798 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 MORN4Q8NDC4 146 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 PXT1Q8NFP0 134 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 LILRB4Q8NHJ6 448 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 PROCRQ9UNN8 238 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 GPX5O75715 221 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 GLB1P16278 677 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 ETV6P41212 452 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 CCL7P80098 99 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 SLC43A2Q8N370 569 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 S100A11P31949 105 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 SOX18P35713 384 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 ARL16Q0P5N6 197 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1W2PPH5 198 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 LGALS8O00214 317 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 YIF1AO95070 293 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 GP2P55259 537 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 P2RX3P56373 397 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 SELENBP1Q13228 472 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 EDEM2Q9BV94 578 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 KCNG2Q9UJ96 466 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM129A0AVI4 362 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 DVL1O14640 695 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 PI3P19957 117 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 CMTM2Q8TAZ6 248 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 C3orf49Q96BT1 292 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 WDR1O75083 606 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 TGM6O95932 706 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 HBE1P02100 147 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 GLRA1P23415 457 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 SHISA8B8ZZ34 492 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF195O14628 629 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 B4GALT1P15291 398 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF266Q14584 549 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 THEM4Q5T1C6 240 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 SFT2D1Q8WV19 159 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 PPM1DO15297 605 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 S100A7P31151 101 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 SOHLH1Q5JUK2 328 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 PHYHIPQ92561 330 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 REEP6Q96HR9 211 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 LAP3P28838 519 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 MEIKINA0A087WXM9 373 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 VAMP5O95183 116 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 CHRM2P08172 466 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 SLC35A2P78381 396 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 OR2L13Q8N349 312 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 GINS3Q9BRX5 216 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 MED18Q9BUE0 208 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 HPNP05981 417 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF626Q68DY1 528 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 OR10K2Q6IF99 312 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 NAA40Q86UY6 237 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 NANPQ8TBE9 248 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 TIMD4Q96H15 378 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 BTAF1O14981 1849 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 UBAC2Q8NBM4 344 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 OR2G3Q8NGZ4 309 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF75AQ96N20 296 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 NRASP01111 189 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 DIO1P49895 249 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 FABP6P51161 128 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRF-209ENST00000438120 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms