RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF774Q6NX45 483 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC7A6Q92536 515 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 C7orf34Q96L11 122 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SPACA5Q96QH8 159 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR14A2Q96R54 314 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ABHD6Q9BV23 337 aa6.3□□□□□ -1.4
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LRRTM3-201ENST00000361320 RAB9BQ9NP90 201 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1B0GVC2 190 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 C17orf51A8MQB3 221 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MPPED1O15442 326 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 GPANK1O95872 356 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CAPNS1P04632 268 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 C1QTNF9P0C862 333 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CRHBPP24387 322 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 Q499Y3 187 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR2T2Q6IF00 324 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ENY2Q9NPA8 101 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A1B0GW55 424 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DISC1C4P0D8 188 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 LRRTM2O43300 516 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 IFNA21P01568 189 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 IGKV3-11P04433 115 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.3□□□□□ -1.4
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LRRTM3-201ENST00000361320 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NFYBP25208 207 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PRSS12P56730 875 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SPARTQ8N0X7 666 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ACBD4Q8NC06 268 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CCL17Q92583 94 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FCRL1Q96LA6 429 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NOX4Q9NPH5 578 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NTMQ9P121 344 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DUX4Q9UBX2 424 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NME2P1O60361 137 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 CTLA4P16410 223 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NME2P22392 152 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 GNB2P62879 340 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 DOK3Q7L591 496 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 BORCS5Q969J3 196 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 REEP6Q96HR9 211 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 FUZQ9BT04 418 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.29□□□□□ -1.4
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