RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 RAD52P43351 418 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ADIRFQ15847 76 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ASB13Q8WXK3 278 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 JAM3Q9BX67 310 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 DSCR3O14972 297 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 GLAP06280 429 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 EDDM3BP56851 147 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 STAC2Q6ZMT1 411 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM15Q7Z3B0 74 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 KCNG2Q9UJ96 466 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 IL3RAP26951 378 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 FAM53BQ14153 422 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35G3Q8N808 338 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PATE1Q8WXA2 126 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TWSG1Q9GZX9 223 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 R4GMQ9 66 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SLC17A1Q14916 467 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PCK2Q16822 640 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 AARDQ4LEZ3 155 aa19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 NKX6-3A6NJ46 265 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PNLIPRP2P54317 469 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR10A3P58181 314 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf76Q3KRA6 126 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CATSPERDQ86XM0 798 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR52H1Q8NGJ2 320 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 STT3BQ8TCJ2 826 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM10O14672 748 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CAPZBP47756 277 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 IL21Q9HBE4 155 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 HIF1ANQ9NWT6 349 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR5H14A6NHG9 310 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 IMPA2O14732 288 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 GUSBP08236 651 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF628Q5EBL2 1059 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC11Q96RL6 698 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CTSFQ9UBX1 484 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 M0R135 149 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ENSAO43768 121 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 USP51Q70EK9 711 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF439Q8NDP4 499 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR13C5Q8NGS8 318 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR51F2Q8NH61 342 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF799Q96GE5 643 aa19.23■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR8U8P0C7N1 319 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SELEP16581 610 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TBXA2RP21731 343 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF85Q03923 595 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR52N5Q8NH56 324 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PHIPQ8WWQ0 1821 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP92A6NM28 416 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ICOSLGO75144 302 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 EDN3P14138 238 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR10Z1Q8NGY1 313 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM19Q9H013 955 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 RPH3ALQ9UNE2 315 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PEX11BO96011 259 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SOX18P35713 384 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 KCNAB1Q14722 419 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CTF1Q16619 201 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR51H1Q8NH63 302 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR2AE1Q8NHA4 323 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR2A14Q96R47 310 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TEX101Q9BY14 249 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 GPR84Q9NQS5 396 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD10Q9NXR5 420 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ACKR3P25106 362 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFA6P56556 154 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 BTG2P78543 158 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC74AQ96AQ1 378 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A6Q9Y289 635 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 OR51B4Q9Y5P0 310 aa19.22■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 ADRB1P08588 477 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 VWA2Q5GFL6 755 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 TOR2AQ5JU69 321 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 CORO6Q6QEF8 472 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 BAGE3Q86Y29 109 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 BAGE2Q86Y30 109 aa19.21■□□□□ 0.67
CCSAP-201ENST00000284617 APH1BQ8WW43 257 aa19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms