RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr485A0A140LJF5 317 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv5-37A0A140T8N4 115 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc10bG3XA50 292 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GzmmO08643 264 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Map2k3O09110 347 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc23O35125 340 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam10O35598 749 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P2rx1P51576 399 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CcnfP51944 777 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Idh3gP70404 393 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp41Q02526 198 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BcheQ03311 603 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam107bQ3TGF2 131 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Armcx5Q3UZB0 606 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mks1Q5SW45 561 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf145Q5SWK7 663 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a26Q5U680 274 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FaddQ61160 205 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dlx1Q64317 255 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgef4Q7TNR9 484 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sult2a8Q8BGL3 282 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prrg4Q8BGN6 226 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf879Q8BI99 563 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csnk1a1Q8BK63 337 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhbdd3Q8BP97 385 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Flywch1Q8CI03 673 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Coq6Q8R1S0 476 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc80Q8R2G6 949 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akr1d1Q8VCX1 325 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr493Q8VEW5 314 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1048Q8VGS2 320 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr974Q8VH09 310 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdhr5Q8VHF2 831 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nsmce2Q91VT1 247 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp6v1c2Q99L60 427 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pga5Q9D106 387 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GrifinQ9D1U0 144 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem269Q9D4Y8 254 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sec23bQ9D662 767 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec2gQ9D676 269 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MrrfQ9D6S7 262 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssmem1Q9D9Y8 244 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plin3Q9DBG5 437 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hao1Q9WU19 370 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gsk3bQ9WV60 420 aa9.66□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2abC0HKE1 130 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2acC0HKE2 130 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2adC0HKE3 130 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2aeC0HKE4 130 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2agC0HKE5 130 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2aiC0HKE6 130 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2anC0HKE7 130 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2aoC0HKE8 130 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2apC0HKE9 130 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdc20bD3Z3I0 519 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prdm13E9PZZ1 754 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr251E9Q891 316 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpinb6bO08804 377 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 VimP20152 466 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd3eP22646 189 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col8a2P25318 699 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mas1P30554 324 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Capza2P47754 286 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ca10P61215 328 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pou3f4P62515 361 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bcl2l2P70345 193 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmprss11bQ14C59 416 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r11Q3SXA2 299 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EcscrQ3TZW0 214 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SbsponQ3UPR9 264 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Commd6Q3V4B5 87 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr324Q5NCC7 333 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpinf2Q61247 491 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp92Q62396 488 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt8Q64676 541 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxb1Q64732 325 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Orai3Q6P8G8 290 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1308Q7TQX0 320 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist3h2aQ8BFU2 130 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plppr1Q8BFZ2 325 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh3bgrl2Q8BG73 107 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam234bQ8BYI8 624 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxw19Q8C2W8 466 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2afQ8CGP5 130 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2ahQ8CGP6 128 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h2akQ8CGP7 130 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H1fntQ8CJI4 398 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2afjQ8R1M2 129 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Utp4Q8R2N2 686 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D1Ertd622eQ8VEB3 207 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1453Q8VFX0 307 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cisd1Q91WS0 108 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scpep1Q920A5 452 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Med31Q9CXU1 131 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lingo1Q9D1T0 614 aa9.65□□□□□ -0.86
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ribc2Q9D4Q1 309 aa9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.6 ms