RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 FNDC9Q8TBE3 224 aa20.1■□□□□ 0.81
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CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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CAPNS1-207ENST00000589146 TUSC5Q8IXB3 177 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF676Q8N7Q3 588 aa20.07■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 ASH2LQ9UBL3 628 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC13O75165 2243 aa20.06■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa20.06■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 PIN1P1O15428 100 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 CST2P09228 141 aa20.06■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 GPR148Q8TDV2 347 aa20.06■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 OR14A2Q96R54 314 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 WACQ9BTA9 647 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa20.06■□□□□ 0.8
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CAPNS1-207ENST00000589146 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM206AQ9NX38 181 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXL3Q9UKT7 428 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC22A20A6NK97 555 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 RAF1P04049 648 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 ISG15P05161 165 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 S100A5P33763 92 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 UCNP55089 124 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-207ENST00000589146 GRB2P62993 217 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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