RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LRP11Q86VZ4 500 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 AKR7LQ8NHP1 331 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF519Q8TB69 540 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SNX33Q8WV41 574 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CD300AQ9UGN4 299 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SIGLEC7Q9Y286 467 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 JMJD1CQ15652 2540 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SOCS2O14508 198 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SLC16A7O60669 478 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PTP4A3O75365 173 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 STAMBPO95630 424 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MT-ND5P03915 603 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 CST2P09228 141 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 LYNX1P0DP58 116 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NAT2P11245 290 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MSR1P21757 451 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PEX2P28328 305 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NOS3P29474 1203 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 GCH1P30793 250 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SDHAP31040 664 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RRM2P31350 389 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 OMPP47874 163 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 GZMKP49863 264 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ERVS71-1P61550 626 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PSG4Q00888 419 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FHL1Q13642 323 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 TRIP10Q15642 601 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 FXNQ16595 210 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MOGQ16653 247 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 MSMPQ1L6U9 139 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SPATS1Q496A3 300 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZNX1 250 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 NABP1Q96AH0 204 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 RASD2Q96D21 266 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRM-214ENST00000583153 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS37A4D1T9 235 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LRP5LA4QPB2 252 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CRLF1O75462 422 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R3DO95685 299 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SNAP29O95721 258 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF23P17027 643 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A6P31641 620 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LIMS1P48059 325 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGDIAP52565 204 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GLO1Q04760 184 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 RFX4Q33E94 735 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MESTQ5EB52 335 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF774Q6NX45 483 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ARL9Q6T311 187 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 DHFR2Q86XF0 187 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF786Q8N393 782 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD4Q8TB40 342 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.14□□□□□ -1.27
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