RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LHFPL6Q9Y693 200 aa11.15□□□□□ -0.62
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRODHO43272 600 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SGCEO43556 437 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DOK2O60496 412 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BAG2O95816 211 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SOD3P08294 240 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLUP10909 449 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF823P16415 610 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PCSK6P29122 969 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EPHA2P29317 976 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FMO3P31513 532 aa11.14□□□□□ -0.63
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 GGT2P36268 569 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FABP6P51161 128 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAD23AP54725 363 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST1H3AP68431 136 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAB35Q15286 201 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNAPC1Q16533 368 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AGAP6Q5VW22 663 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OTPQ5XKR4 325 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C12orf73Q69YU5 71 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLBD1Q6P4A8 553 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HIST2H3AQ71DI3 136 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FBXL14Q8N1E6 418 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MUC15Q8N387 334 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GJC3Q8NFK1 279 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR51L1Q8NGJ5 315 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR6K6Q8NGW6 343 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNRF4Q8WWF5 429 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PTP4A1Q93096 173 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EME1Q96AY2 570 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OTULINQ96BN8 352 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POM121L2Q96KW2 1035 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HCAR1Q9BXC0 346 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GRIP2Q9C0E4 1043 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RIBC2Q9H4K1 309 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MED20Q9H944 212 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TVP23BQ9NYZ1 205 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MED13LQ71F56 2210 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.14□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ITPR3Q14573 2671 aa11.13□□□□□ -0.63
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 C5orf49A4QMS7 147 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR6C6A6NF89 314 aa11.13□□□□□ -0.63
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 GLCEO94923 617 aa11.13□□□□□ -0.63
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LINC01590Q5TEZ4 76 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRT80Q6KB66 452 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC18B1Q6NT16 456 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CPOQ8IVL8 374 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CDADC1Q9BWV3 514 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HDHD2Q9H0R4 259 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CXorf56Q9H5V9 222 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CBLN4Q9NTU7 201 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLEK2Q9NYT0 353 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 F8P00451 2351 aa11.13□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TVP23AA6NH52 213 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VSTM5A8MXK1 200 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RER1O15258 196 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRKYO43930 277 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CD8AP01732 235 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANPEPP15144 967 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PAX1P15863 534 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC2A5P22732 501 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 THBS4P35443 961 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GLRXP35754 106 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SERPINF1P36955 418 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAD52P43351 418 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HTR5AP47898 357 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ENTPD1P49961 510 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EFNB3Q15768 340 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADIPOQQ15848 244 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PCK2Q16822 640 aa11.12□□□□□ -0.63
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
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