RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	WWP2	O00308	870 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	HCRTR1	O43613	425 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CRLF1	O75462	422 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2F2	O95006	317 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	H6PD	O95479	791 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TSPAN13	O95857	204 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	STAG3L3	P0CL85	134 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ABO	P16442	354 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP6V1B2	P21281	511 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ZP3	P21754	424 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SHMT2	P34897	504 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	UGT1A3	P35503	534 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	P2RY2	P41231	377 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	KLK7	P49862	253 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ARPP19	P56211	112 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	RIPPLY3	P57055	190 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF33A	Q06730	810 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TWF1	Q12792	350 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	MERTK	Q12866	999 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	IL18	Q14116	193 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TGFBI	Q15582	683 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE2S	Q16763	222 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308		Q6ZS52	159 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF677	Q86XU0	584 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	RDH10	Q8IZV5	341 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	C6orf223	Q8N319	242 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	CADM2	Q8N3J6	435 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	NRGN	Q92686	78 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	KIFAP3	Q92845	792 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	FGGY	Q96C11	551 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308		Q9H3A6	140 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SNHG1-222	ENST00000545308	COL4A2	P08572	1712 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	MYH11	P35749	1972 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	SMCO3	A2RU48	225 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308		E7EWF7	191 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308		L7N2F9	121 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CLOCK	O15516	846 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2J3	O76001	311 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV3-48	P01763	117 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	SEMG1	P04279	462 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	PRB1	P04280	392 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	APOD	P05090	189 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	GABRR2	P28476	465 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	SEMG2	Q02383	582 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ILK	Q13418	452 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CHRNA6	Q15825	494 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	GSG1	Q2KHT4	349 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	PARP15	Q460N3	678 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ARC	Q7LC44	396 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	SCD5	Q86SK9	330 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93

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