RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544179.1

TM7SF3-216, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TM7SF3, Length 412 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-216ENST00000544179 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SLC8B1Q6J4K2 584 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 NIPAL3Q6P499 406 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ULK3Q6PHR2 472 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 NT5DC3Q86UY8 548 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CMTM8Q8IZV2 173 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 LRRC18Q8N456 261 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 OR11L1Q8NGX0 322 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 OR4A16Q8NH70 328 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TMBIM1Q969X1 311 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SLC35C1Q96A29 364 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PFDN5Q99471 154 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 RSG1Q9BU20 258 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TMEM109Q9BVC6 243 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TSSK1BQ9BXA7 367 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 LRRC2Q9BYS8 371 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TRIM9Q9C026 710 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 IFT46Q9NQC8 304 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 RWDD2AQ9UIY3 292 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PREX1Q8TCU6 1659 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 AKAP12Q02952 1782 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CHD5Q8TDI0 1954 aa3.45□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ANKARQ7Z5J8 1434 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PTPRUQ92729 1446 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ATP10DQ9P241 1426 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 WNK3Q9BYP7 1800 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PCM1Q15154 2024 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 A0A1W2PRG6 482 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SAGE2PA6NJ88 616 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SHISA9B4DS77 424 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PDXKO00764 312 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PHOX2AO14813 284 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SIVA1O15304 175 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 NBR2O15453 112 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 XRCC2O43543 280 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 FADS1O60427 444 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SNAP91O60641 907 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 UGT1A9O60656 530 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CCDC22O60826 627 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 LRP3O75074 770 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SH3BGRLO75368 114 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 GRAP2O75791 330 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 VAPBO95292 243 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 EPOP01588 193 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 OCM2P0CE71 109 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PET100P0DJ07 73 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 GP9P14770 177 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CD1EP15812 388 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TSPAN8P19075 237 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 NPR2P20594 1047 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 STOMP27105 288 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CALCRP30988 508 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CCR7P32248 378 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 RCVRNP35243 200 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 RGRP47804 291 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CYB561P49447 251 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PRELPP51888 382 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PLA2G16P53816 162 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 KCNJ2P63252 427 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 LCN2P80188 198 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 AESQ08117 197 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 CEACAM7Q14002 265 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TNXAQ16473 311 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ACKR1Q16570 336 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 NDUFA9Q16795 377 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 DUSP7Q16829 419 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SLC36A2Q495M3 483 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 OR2G6Q5TZ20 316 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 TRIQKQ629K1 86 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 SLC22A10Q63ZE4 541 aa3.44□□□□□ -1.86
TM7SF3-216ENST00000544179 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms