RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 POU4F2Q12837 409 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL22Q53GT1 634 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 PHYHD1Q5SRE7 291 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZT83 130 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 BBS1Q8NFJ9 593 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 APH1BQ8WW43 257 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 NEUROG1Q92886 237 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 FBXW5Q969U6 566 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 AASSQ9UDR5 926 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 PRSS50Q9UI38 385 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PPL8 197 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 DCTN6O00399 190 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 FAM20BO75063 409 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 FARS2O95363 451 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 SOD3P08294 240 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC159P0C7I6 412 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 CLUP10909 449 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF823P16415 610 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 SLC2A5P22732 501 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 GSTT1P30711 240 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 CDKN1AP38936 164 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 MTNR1AP48039 350 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 P2RY6Q15077 328 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 ETFDHQ16134 617 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 NRN1LQ496H8 165 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 NCMAPQ5T1S8 102 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 ADAM5Q6NVV9 412 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF786Q8N393 782 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 HSD17B8Q92506 261 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 FOXB1Q99853 325 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 KCNN2Q9H2S1 579 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 CIB4A0PJX0 185 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 LYZL6O75951 148 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 MSR1P21757 451 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 EDNRAP25101 427 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 NUDT6P53370 316 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 ARF1P84077 181 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 BSPH1Q075Z2 132 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 KCNMB1Q16558 191 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 SGCAQ16586 387 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 LINC01590Q5TEZ4 76 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 INTS14Q96SY0 518 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 WACQ9BTA9 647 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 CDADC1Q9BWV3 514 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 NELFAQ9H3P2 528 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 SIAEQ9HAT2 523 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 AMBNQ9NP70 447 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM38BQ9NVV0 291 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 TAS2R16Q9NYV7 291 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.88□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC182A6NF36 153 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 DPRXA6NFQ7 191 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 TVP23AA6NH52 213 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 OVOL3O00110 214 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 SLC1A7O00341 560 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 CRLF1O75462 422 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 DANCRP0C864 163 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.87□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV1-2P23083 117 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms