RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502394.1

MATR3-231, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 589 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-231	ENST00000502394	DPPA5	A6NC42	116 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	HSPB2	A8KAH6	182 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394		E9PLN8	166 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	SULT1C4	O75897	302 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	VSIG8	P0DPA2	414 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	B4GALT1	P15291	398 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	CTSS	P25774	331 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	TGFBR2	P37173	567 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	CAPZA2	P47755	286 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	PER3	P56645	1201 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	ACTA2	P62736	377 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	ACTG2	P63267	376 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	RELB	Q01201	579 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	FAP	Q12884	760 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	HSPB2	Q16082	182 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	SGCA	Q16586	387 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	TIGD6	Q17RP2	521 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394		Q6ZT83	130 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	SATL1	Q86VE3	508 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	ATCAY	Q86WG3	371 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	YIPF6	Q96EC8	236 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	FBXO17	Q96EF6	278 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	PELI1	Q96FA3	418 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	C4orf36	Q96KX1	117 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	MGLL	Q99685	303 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	WAC	Q9BTA9	647 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	BATF3	Q9NR55	127 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		10.65	□□□□□ -0.7
MATR3-231	ENST00000502394	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394		A0A0G2JNJ9	132 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	METTL15	A6NJ78	407 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394		E9PI62	339 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	TMCC2	O75069	709 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	KRT33A	O76009	404 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	MT-ND5	P03915	603 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	IGHV1-2	P23083	117 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	PSMB9	P28065	219 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	TTK	P33981	857 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	LIPA	P38571	399 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	OPRL1	P41146	370 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	PMPCA	Q10713	525 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	AQP6	Q13520	282 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	TPBG	Q13641	420 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	MED22	Q15528	200 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SSX1	Q16384	188 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	TP53I3	Q53FA7	332 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	CORO6	Q6QEF8	472 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SYT9	Q86SS6	491 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SKA3	Q8IX90	412 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	THEM6	Q8WUY1	208 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	C1orf198	Q9H425	327 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394		Q9UFV3	132 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	PROCR	Q9UNN8	238 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	MEMO1	Q9Y316	297 aa		10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394		J3QLW9	94 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	RER1	O15258	196 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	OGG1	O15527	345 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF254	O75437	659 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	CPE	P16870	476 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF19	P17023	458 aa		10.63	□□□□□ -0.71
MATR3-231	ENST00000502394	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71

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