RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	VDAC3	Q9Y277	283 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	POLE	Q07864	2286 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC182	A6NF36	153 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717		G3V3Y1	287 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717		M0R129	80 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	CTDSP2	O14595	271 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	IDH3B	O43837	385 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2T1	O43869	369 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	MPZL2	O60487	215 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	NDUFB2	O95178	105 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	RCBTB2	O95199	551 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TNFAIP8	O95379	198 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC2A10	O95528	541 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	CH25H	O95992	272 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TFAP2A	P05549	437 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	CD14	P08571	375 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM11	P17152	192 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	PCMT1	P22061	227 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	CXCR1	P25024	350 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	PCSK6	P29122	969 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	GRPR	P30550	384 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	PCYT1A	P49585	367 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	SMS	P52788	366 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	CLDN18	P56856	261 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	PRPS1	P60891	318 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	MYBPH	Q13203	477 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	GGTLC2	Q14390	218 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	GINS1	Q14691	196 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	MEST	Q5EB52	335 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	RNLS	Q5VYX0	342 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	XAF1	Q6GPH4	301 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	OAF	Q86UD1	273 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2T33	Q8NG76	320 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	SGCD	Q92629	289 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	DDIT4L	Q96D03	193 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	WDFY2	Q96P53	400 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TIMP4	Q99727	224 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	APOL4	Q9BPW4	351 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	MARCH7	Q9H992	704 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	NANS	Q9NR45	359 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	SELENON	Q9NZV5	590 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	RTTN	Q86VV8	2226 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DCTN1-222	ENST00000492717	COL12A1	Q99715	3063 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A0J9YW62	118 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF716	A6NP11	495 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717		A8MZ25	164 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	RAMP1	O60894	148 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2C1	O95371	312 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	AHSA1	O95433	338 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	NUDT14	O95848	222 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	F10	P00742	488 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF708	P17019	499 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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