RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 SIGLEC14Q08ET2 396 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 ATP6AP1Q15904 470 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 PSG3Q16557 428 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 NRF1Q16656 503 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 ATP6V1FQ16864 119 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 PEX26Q7Z412 305 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.63□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.63□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 SERPINB12Q96P63 405 aa3.63□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.63□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 KCNJ16Q9NPI9 418 aa3.63□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 BTNL2Q9UIR0 455 aa3.63□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 H3BN98 237 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 TNFSF11O14788 317 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 AGPAT2O15120 278 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 SERF1AO75920 110 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 PLEKHA8P1O95397 391 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 TDP2O95551 362 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 P0C879 139 aa3.62□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 KLK2P20151 261 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 BGNP21810 368 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 CRATP43155 626 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 KLK7P49862 253 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 SLC26A2P50443 739 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 CCR8P51685 355 aa3.62□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 ZSCAN26Q16670 478 aa3.62□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 CLEC6AQ6EIG7 209 aa3.62□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 UNC93AQ86WB7 457 aa3.62□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.62□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 SYT4Q9H2B2 425 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 NRBP2Q9NSY0 501 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 CLN6Q9NWW5 311 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.62□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 CEP170Q5SW79 1584 aa3.62□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 ADCY10Q96PN6 1610 aa3.62□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 VAPBO95292 243 aa3.61□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
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CCL20-204ENST00000489160 TFDP2Q14188 446 aa3.61□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 C5orf64Q2M2E5 130 aa3.61□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 ZBED5Q49AG3 693 aa3.61□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.61□□□□□ -1.83
CCL20-204ENST00000489160 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.61□□□□□ -1.83
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