RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488601.6

POLR1C-208, Transcript of RNA polymerase I and III subunit C, human

TSL 2

Gene POLR1C, Length 973 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1C-208	ENST00000488601	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67	3e-6	■■■□□ 16.9
POLR1C-208	ENST00000488601	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	FDFT1	P37268	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	ACVR1	Q04771	509 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	DECR1	Q16698	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	OMA1	Q96E52	524 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	GFI1	Q99684	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	MED11	Q9P086	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601		E5RI56	91 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601		J3QR06	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	CCL24	O00175	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	AP3B1	O00203	1094 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	MANBA	O00462	879 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	OR1F1	O43749	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	PAH	P00439	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	LIPF	P07098	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	APRT	P07741	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	ATP5D	P30049	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	GLRX	P35754	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	GP5	P40197	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	GRIA1	P42261	906 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	RAB13	P51153	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	LIM2	P55344	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	BIK	Q13323	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	RCN2	Q14257	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	CTF1	Q16619	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601		A0A0B4J293	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601		A0A1W2PPW3	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	TGOLN2	O43493	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	VAPB	O95292	243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	CH25H	O95992	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	IFNB1	P01574	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	ETS2	P15036	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POLR1C-208	ENST00000488601	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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