RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484483.1

PTP4A2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 2

Gene PTP4A2, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-205	ENST00000484483	E2F6	O75461	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	TIPRL	O75663	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	UBL3	O95164	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC2A10	O95528	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	RAF1	P04049	648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SERPINA5	P05154	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CECR9	P0C854	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	OSM	P13725	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CD53	P19397	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	GSTM3	P21266	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRKACG	P22612	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CDA	P32320	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	LCN6	P62502	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	NAAA	Q02083	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	FMOD	Q06828	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	NPRL3	Q12980	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CCNI	Q14094	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ODF1	Q14990	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ETFDH	Q16134	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SGCA	Q16586	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	MEST	Q5EB52	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PIGT	Q969N2	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	RASD2	Q96D21	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	RNF121	Q9H920	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	LRBA	P50851	2863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	BHLHE40	O14503	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	RAB36	O95755	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	REN	P00797	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CRYAA	P02489	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	SOD3	P08294	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	FCGR1A	P12314	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ANXA8	P13928	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CTLA4	P16410	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	MSR1	P21757	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	FAS	P25445	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	LAP3	P28838	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CRABP1	P29762	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	CALCR	P30988	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	TTK	P33981	857 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	FABP6	P51161	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	ACTR3	P61158	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-205	ENST00000484483	HGFAC	Q04756	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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