RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CRMP1	Q14194	572 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	MST1L	Q2TV78	715 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR2T4	Q8NH00	348 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902		Q96MF0	132 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	WAC	Q9BTA9	647 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SNAP29	O95721	258 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	IGHV4-39	P01824	125 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZNF3	P17036	446 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	HTR5A	P47898	357 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	UCP2	P55851	309 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	TEK	Q02763	1124 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	GINS1	Q14691	196 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SYT3	Q9BQG1	590 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	DUSP13	Q9UII6	198 aa		15.3	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SSX4	O60224	188 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	GYPB	P06028	91 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	GAA	P10253	952 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZNF823	P16415	610 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	GRK5	P34947	590 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	NUDT6	P53370	316 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ACTR3	P61158	418 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	EFNB3	Q15768	340 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	KCNMB1	Q16558	191 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	CORO6	Q6QEF8	472 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	TEX12	Q9BXU0	123 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	DLL4	Q9NR61	685 aa		15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPW3	197 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	TVP23A	A6NH52	213 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	FAM183A	A6NL82	134 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902		H7C417	338 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	RER1	O15258	196 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	TF	P02787	698 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PCSK6	P29122	969 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	DAP	P51397	102 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SELENOV	P59797	346 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ERVS71-1	P61550	626 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ARL9	Q6T311	187 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	GJC3	Q8NFK1	279 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	DDO	Q99489	341 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	MED20	Q9H944	212 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	CMC2	Q9NRP2	79 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	KRT84	Q9NSB2	600 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		15.28	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	HMGN1	P05114	100 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	COX5B	P10606	129 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	CLU	P10909	449 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	FOSL1	P15407	271 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	FMO3	P31513	532 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	MSMP	Q1L6U9	139 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	FAHD1	Q6P587	224 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	LRP11	Q86VZ4	500 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ABHD4	Q8TB40	342 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		15.27	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SLC7A6	Q92536	515 aa		15.27	■□□□□ 0.04

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