RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 PGAM4Q8N0Y7 254 aa23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 PYURFQ96I23 114 aa23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 WNT9BO14905 357 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 NGFP01138 241 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 GAAP10253 952 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 AQP6Q13520 282 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SEC23BQ15437 767 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 THSD4Q6ZMP0 1018 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ZER1Q7Z7L7 766 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 GLB1L2Q8IW92 636 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 NPEPL1Q8NDH3 523 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 RASD2Q96D21 266 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ELMOD3Q96FG2 381 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 DIRC2Q96SL1 478 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 FUZQ9BT04 418 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SYT4Q9H2B2 425 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TBCCD1Q9NVR7 557 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TREM2Q9NZC2 230 aa23.63■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 UNC119BA6NIH7 251 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 CLDN25C9JDP6 229 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SGCEO43556 437 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 DOK2O60496 412 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 DIRAS1O95057 198 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ABHD16AO95870 558 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TXNDC12O95881 172 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 IGHV1-46P01743 117 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SEMG1P04279 462 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 MSMBP08118 114 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 RPS6KA3P51812 740 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 LMO4P61968 165 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 LSM6P62312 80 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TSTQ16762 297 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 HFEQ30201 348 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 OR51F2Q8NH61 342 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM186Q96B77 213 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 EGLN1Q9GZT9 426 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM157AC9JC47 383 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC16A7O60669 478 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ANPEPP15144 967 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 GSTM3P21266 225 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SRP14P37108 136 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 HTR5AP47898 357 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 FXYD6P3P58550 94 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM255AQ5JRV8 349 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SMARCD3Q6STE5 483 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 OR52J3Q8NH60 311 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TIMD4Q96H15 378 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 CD300AQ9UGN4 299 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 IL20RAQ9UHF4 553 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TAGLN3Q9UI15 199 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 KLHL21Q9UJP4 597 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa23.61■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SOCS2O14508 198 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SPRY3O43610 288 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 GADD45GO95257 159 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SPATS1Q496A3 300 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 NSMCE2Q96MF7 247 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 LRRC37BQ96QE4 947 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 HIF1ANQ9NWT6 349 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 NDE1Q9NXR1 346 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 PLEK2Q9NYT0 353 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ATPIF1Q9UII2 106 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 V9GYQ6 96 aa23.6■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 CRABP1P29762 137 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 MVKQ03426 396 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 PGM2L1Q6PCE3 622 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 DNM1P34Q6PK57 102 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 RFLNBQ8N5W9 214 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 RAB1CQ92928 201 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 RAB39BQ96DA2 213 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 COG8Q96MW5 612 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 NUAK2Q9H093 628 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 RERGLQ9H628 205 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ASH2LQ9UBL3 628 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 WIPI2Q9Y4P8 454 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 TRAV20A0A0B4J274 112 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 IMPA2O14732 288 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 ARPC2O15144 300 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 DCTN3O75935 186 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 CD55P08174 381 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SPIBQ01892 262 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC3A1Q07837 685 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNMB1Q16558 191 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 MTX3Q5HYI7 312 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 AVPI1Q5T686 147 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 LIPNQ5VXI9 398 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 RINLQ6ZS11 566 aa23.58■■□□□ 1.37
ANKRD54-203ENST00000407117 PTCHD4Q6ZW05 846 aa23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms