RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 MPZL1O95297 269 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SCG5P05408 212 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4A8P0C604 315 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 GAAP10253 952 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 PAX1P15863 534 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 CCNOP22674 350 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 IGFBP5P24593 272 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 FMO3P31513 532 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 THBS4P35443 961 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 GLRXP35754 106 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 RIPPLY3P57055 190 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SELENOVP59797 346 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 KDM4DQ6B0I6 523 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT80Q6KB66 452 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ACSM5Q6NUN0 579 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF774Q6NX45 483 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 OTULINQ96BN8 352 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 POM121L2Q96KW2 1035 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 PKP2Q99959 881 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 BCL2L14Q9BZR8 327 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 WNT5BQ9H1J7 359 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 CXXC4Q9H2H0 198 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEK2Q9NYT0 353 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ATPIF1Q9UII2 106 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ORC6Q9Y5N6 252 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SAC3D1A6NKF1 404 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 DOK2O60496 412 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 CD8AP01732 235 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SPI1P17947 270 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 PYCR1P32322 319 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 HTR5AP47898 357 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 PTH2RP49190 550 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 EFNB3Q15768 340 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ADIPOQQ15848 244 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SHEQ5VZ18 495 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ELOVL3Q9HB03 270 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 OR6C6A6NF89 314 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SURF4O15260 269 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 TFP02787 698 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 CCL2P13500 99 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 EVX1P49640 407 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 UCP2P55851 309 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP5J2P56134 94 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAM8P78325 824 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ECH1Q13011 328 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB35Q15286 201 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SNAPC1Q16533 368 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 PRSS57Q6UWY2 283 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 OR6K6Q8NGW6 343 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 OR1F12Q8NHA8 337 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 PERPQ96FX8 193 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 HDHD2Q9H0R4 259 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 PLK3Q9H4B4 646 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 TVP23BQ9NYZ1 205 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR160Q9UJ42 338 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa13.27□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 LOC100509620A0A075B734 347 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 RER1O15258 196 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 MITFO75030 526 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 BAG2O95816 211 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 LCKP06239 509 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM157BP0CG42 384 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 TUBG1P23258 451 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 RAD23AP54725 363 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP2R2BQ00005 443 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 TESK1Q15569 626 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 MOGQ16653 247 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 MEP1BQ16820 701 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 SWI5Q1ZZU3 235 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 ELFN2Q5R3F8 820 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 C11orf71Q6IPW1 123 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 SPNS3Q6ZMD2 512 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 PQLC1Q8N2U9 271 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51L1Q8NGJ5 315 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 COG8Q96MW5 612 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 PITX2Q99697 317 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 CIB1Q99828 191 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf16Q9BUW7 83 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 CACNG6Q9BXT2 260 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 OR51V1Q9H2C8 321 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 TUBG2Q9NRH3 451 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 LHFPL6Q9Y693 200 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1B-202ENST00000379615 MED13LQ71F56 2210 aa13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms