RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 KCNN2Q9H2S1 579 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 LAMA5O15230 3695 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa21.62■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 FBXW9Q5XUX1 488 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 RPTNQ6XPR3 784 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF627Q7L945 461 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 LINGO2Q7L985 606 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 SYT9Q86SS6 491 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 CD163Q86VB7 1156 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 C9orf106Q8NAJ2 232 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 OR6K3Q8NGY3 331 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 RPS4Y2Q8TD47 263 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 LRP12Q9Y561 859 aa21.62■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa21.61■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 CORO6Q6QEF8 472 aa21.61■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC22A24Q8N4F4 322 aa21.61■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 MAP6Q96JE9 813 aa21.61■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa21.61■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 GPX5O75715 221 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 RPP14O95059 124 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 ATE1O95260 518 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 PER3P56645 1201 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC3A1Q07837 685 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 SCRN3Q0VDG4 424 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 GFRALQ6UXV0 394 aa21.6■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 TMED9Q9BVK6 235 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 C12orf49Q9H741 205 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 CENPMQ9NSP4 180 aa21.6■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNHIT1O43257 154 aa21.59■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 MPGP29372 298 aa21.59■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 UGT2B10P36537 528 aa21.59■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 VBP1P61758 197 aa21.59■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 OR7E24Q6IFN5 339 aa21.59■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF813Q6ZN06 617 aa21.59■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 CFAP77Q6ZQR2 320 aa21.59■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 GHSRQ92847 366 aa21.59■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM203Q969S6 136 aa21.59■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM212A6NML5 194 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 ERVH48-1M5A8F1 160 aa21.58■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 TUBA1BP68363 451 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 HIST1H3AP68431 136 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 FAPQ12884 760 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 TAF13Q15543 124 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 HIST2H3AQ71DI3 136 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 TUBA1AQ71U36 451 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 SPATC1Q76KD6 591 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 GCNT2Q8N0V5 402 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRC18Q8N456 261 aa21.58■■□□□ 1.05
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ECHDC3-201ENST00000379215 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 R4GMQ9 66 aa21.58■■□□□ 1.05
ECHDC3-201ENST00000379215 EDN3P14138 238 aa21.58■■□□□ 1.04
ECHDC3-201ENST00000379215 HSD11B1P28845 292 aa21.58■■□□□ 1.04
ECHDC3-201ENST00000379215 YIF1BQ5BJH7 314 aa21.58■■□□□ 1.04
ECHDC3-201ENST00000379215 PAMR1Q6UXH9 720 aa21.58■■□□□ 1.04
ECHDC3-201ENST00000379215 TFAP2EQ6VUC0 442 aa21.58■■□□□ 1.04
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC16A14Q7RTX9 510 aa21.58■■□□□ 1.04
ECHDC3-201ENST00000379215 DPPA2Q7Z7J5 298 aa21.58■■□□□ 1.04
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