RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 KCNAB3O43448 404 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OPN1LWP04000 364 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 RLN2P04090 185 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR4E1P0C645 316 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FOLR1P15328 257 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PGCP20142 388 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ACHEP22303 614 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 DNASE1L1P49184 302 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ARL4DP49703 201 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CFHR1Q03591 330 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PMPCAQ10713 525 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 BTN1A1Q13410 526 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ELOCQ15369 112 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TEX30Q5JUR7 227 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 RNF144BQ7Z419 303 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CD163Q86VB7 1156 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FAM46BQ96A09 425 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ARL5BQ96KC2 179 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 MNTQ99583 582 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 EMC6Q9BV81 110 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 B3GNT4Q9C0J1 378 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CENPMQ9NSP4 180 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CTSFQ9UBX1 484 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 VDAC3Q9Y277 283 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ADAM10O14672 748 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NPIPB7O75200 414 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 B3GALNT1O75752 331 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 AHSA1O95433 338 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ITGB2P05107 769 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF735P0CB33 412 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 ANOS1P23352 680 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 OR7A5Q15622 319 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 RAB30Q15771 203 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR52W1Q6IF63 320 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FDX2Q6P4F2 183 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GKN2Q86XP6 184 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 OR1S1Q8NH92 325 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLC6A7Q99884 636 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 MFFQ9GZY8 342 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 GPR160Q9UJ42 338 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRR-202ENST00000342084 FREM3P0C091 2139 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PR77 199 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 HMSDA8MTL9 139 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 A8MVM7 634 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 H3BML4 177 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CDK2AP1O14519 115 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 FADS1O60427 444 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM127O75204 238 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 IGLV3-19P01714 112 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CD2P06729 351 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 C4BPBP20851 252 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 ZP3P21754 424 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 CD38P28907 300 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 SLC26A5P58743 744 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRR-202ENST00000342084 TAS2R19P59542 299 aa6.5□□□□□ -1.37
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