RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 A6NIZ1 184 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 RAP1BP61224 184 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 RAP1AP62834 184 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 C14orf28Q4W4Y0 310 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 ZNF248Q8NDW4 579 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 OR13C3Q8NGS6 347 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 CHST6Q9GZX3 395 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 PPA2Q9H2U2 334 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 ZNF304Q9HCX3 659 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 PFDN2Q9UHV9 154 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 A0A0C4DFX4 3053 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 RHPN2P1A8MT19 583 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 LDLRAD4O15165 306 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 OR4E1P0C645 316 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 DNASE1L1P49184 302 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 ARL4DP49703 201 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 DNM1P34Q6PK57 102 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 ALKAL2Q6UX46 152 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 PCDH15Q96QU1 1955 aa25.11■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 LMO7DNF2Z398 122 aa25.1■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 MELKQ14680 651 aa25.1■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 DEFB133Q30KQ1 61 aa25.1■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 NKAIN3Q8N8D7 197 aa25.1■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 COQ8AQ8NI60 647 aa25.1■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 RFPL4AA6NLU0 287 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 CYB5AP00167 134 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 ZNF823P16415 610 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 PTGS2P35354 604 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 UBXN2BQ14CS0 331 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 VWA2Q5GFL6 755 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 C1orf100Q5SVJ3 147 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 CLVS2Q5SYC1 327 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 MDGA2Q7Z553 956 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 OR6K3Q8NGY3 331 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 CXorf58Q96LI9 332 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 OR11A1Q9GZK7 315 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 EMC9Q9Y3B6 208 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 FTCDNL1E5RQL4 147 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 CD74P04233 296 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 MISPQ8IVT2 679 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 SLC26A10Q8NG04 563 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 OR1L3Q8NH93 324 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 DUSP19Q8WTR2 217 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 TMEM234Q8WY98 164 aa25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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UBP1-201ENST00000283628 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa25.08■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 METTL12A8MUP2 240 aa25.08■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 KRBOX1C9JBD0 128 aa25.08■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 PMPCAQ10713 525 aa25.08■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 ZP4Q12836 540 aa25.08■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 PCK2Q16822 640 aa25.08■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 DEGS2Q6QHC5 323 aa25.08■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 G6PC2Q9NQR9 355 aa25.08■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 OR52A1Q9UKL2 312 aa25.08■■□□□ 1.61
UBP1-201ENST00000283628 BET1O15155 118 aa25.08■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 AMY2AP04746 511 aa25.08■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 RAB6AP20340 208 aa25.08■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 TMEM244Q5VVB8 128 aa25.08■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 OVCH2Q7RTZ1 564 aa25.08■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 SLC51BQ86UW2 128 aa25.08■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 DPYSL5Q9BPU6 564 aa25.08■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 EDEM2Q9BV94 578 aa25.08■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 MFFQ9GZY8 342 aa25.08■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 ALPK2Q86TB3 2170 aa25.07■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 FCER2P06734 321 aa25.07■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 SORDQ00796 357 aa25.07■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 GALNT16Q8N428 558 aa25.07■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 CMKLR1Q99788 373 aa25.07■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 DCDC2BA2VCK2 349 aa25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 NPIPB13A6NJU9 1138 aa25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 A8MXK9 166 aa25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 NPIPB4C9JG80 1138 aa25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 MPZL1O95297 269 aa25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 AGTR1P30556 359 aa25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 DAP3P51398 398 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 JAGN1Q8N5M9 183 aa25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 DEFB119Q8N690 84 aa25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 OR51A2Q8NGJ7 313 aa25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 ST7LQ8TDW4 575 aa25.06■■□□□ 1.6
UBP1-201ENST00000283628 ASB10Q8WXI3 467 aa25.06■■□□□ 1.6
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