RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.34□□□□□ -1.23
COPS4-201ENST00000264389 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
COPS4-201ENST00000264389 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.34□□□□□ -1.23
COPS4-201ENST00000264389 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
COPS4-201ENST00000264389 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.34□□□□□ -1.23
COPS4-201ENST00000264389 AKAP13Q12802 2813 aa7.34□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.34□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 A0A1B0GTH9 108 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 ZNF724A8MTY0 619 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 ZNF879B4DU55 563 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 KRT33AO76009 404 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 FCGR2AP12318 317 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 CPN1P15169 458 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 HSD11B1P28845 292 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 INAQ16352 499 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 FDX2Q6P4F2 183 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 Q6ZS92 163 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 AP3S1Q92572 193 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 NABP1Q96AH0 204 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 MAP6Q96JE9 813 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 CALHM2Q9HA72 323 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 CRLF2Q9HC73 371 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 HMG20AQ9NP66 347 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 DKK4Q9UBT3 224 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 R4GMQ9 66 aa7.33□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 SPTBN2O15020 2390 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 A0A075B6Q4 140 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 SHISA3A0PJX4 238 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 SLC22A20A6NK97 555 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 CLDN25C9JDP6 229 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 AQP7O14520 342 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 PDGFAP04085 211 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 INHBBP09529 407 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 NPR2P20594 1047 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 NTF4P34130 210 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 KIR3DL2P43630 455 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 CCR9P51686 369 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 TMPRSS3P57727 454 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 ZNF846Q147U1 533 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 TAF13Q15543 124 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 ODF4Q2M2E3 257 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 Q499Y3 187 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 LRRC18Q8N456 261 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 PRR7Q8TB68 274 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 PHYHIPQ92561 330 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 THRSPQ92748 146 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 SARAFQ96BY9 339 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 CEP19Q96LK0 163 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 RNF122Q9H9V4 155 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 BCO1Q9HAY6 547 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 ZNF175Q9Y473 711 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 A0A087WV48 116 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 A0A1B0GVC2 190 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 A0A1W2PPK0 400 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 ACOD1A6NK06 481 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 K7ENP7 123 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 RER1O15258 196 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 RGS5O15539 181 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 NCR1O76036 304 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 PNPP00491 289 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 YES1P07947 543 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 UCHL1P09936 223 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 OCM2P0CE71 109 aa7.32□□□□□ -1.24
COPS4-201ENST00000264389 BMP4P12644 408 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms