RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 ENTPD1P49961 510 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PIGFQ07326 219 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 TFF3Q07654 80 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 KCNMB1Q16558 191 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 NRN1LQ496H8 165 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 FAM27BQ5VT28 67 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF627Q7L945 461 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SLC16A14Q7RTX9 510 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SKA3Q8IX90 412 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 OR51G2Q8NGK0 314 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 OR6N2Q8NGY6 317 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 OR52N5Q8NH56 324 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 RNFT2Q96EX2 444 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 INTS14Q96SY0 518 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 AMBNQ9NP70 447 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.45□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 OR5H1A6NKK0 313 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 FAM20BO75063 409 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 UBL3O95164 117 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 APOL3O95236 402 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 WNT11O96014 354 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 HRGP04196 525 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CST2P09228 141 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PATE4P0C8F1 98 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 ATP6V1E1P36543 226 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 MTNR1AP48039 350 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PCBD1P61457 104 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF91Q05481 1191 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 TMED1Q13445 227 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 MED21Q13503 144 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 AQP6Q13520 282 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 GGTLC2Q14390 218 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SLC36A2Q495M3 483 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.44□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 CORO6Q6QEF8 472 aa7.44□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 WDR31Q8NA23 367 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO17Q96EF6 278 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 RNF121Q9H920 327 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 MARCH7Q9H992 704 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.44□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 C19orf84I3L1E1 186 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SLC1A7O00341 560 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 XPNPEP2O43895 674 aa7.43□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 RAB36O95755 333 aa7.43□□□□□ -1.22
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SGMS1-211ENST00000626236 SBK2P0C263 348 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PPP3CBP16298 524 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF32P17041 273 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 HCCSP53701 268 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 RAB1AP62820 205 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SORDQ00796 357 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 POU4F2Q12837 409 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 PPA1Q15181 289 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 TAB1Q15750 504 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 GSG1Q2KHT4 349 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM53Q6P2H8 277 aa7.43□□□□□ -1.22
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