RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.65■□□□□ 0.9
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CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-214ENST00000592483 RFKQ969G6 155 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-214ENST00000592483 BOD1Q96IK1 185 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-214ENST00000592483 MUS81Q96NY9 551 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-214ENST00000592483 HDHD5Q9BXW7 423 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF226Q9NYT6 803 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-214ENST00000592483 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
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CAPNS1-214ENST00000592483 NPR2P20594 1047 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 IL5RAQ01344 420 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 TMED1Q13445 227 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 LCN1P1Q5VSP4 162 aa20.64■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 LINGO2Q7L985 606 aa20.64■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 ENTHD1Q8IYW4 607 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 OR6V1Q8N148 313 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 PROKR2Q8NFJ6 384 aa20.64■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 PTP4A1Q93096 173 aa20.64■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 OR10A4Q9H209 315 aa20.64■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 PAX1P15863 534 aa20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 THAP5Q7Z6K1 395 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 OTULINQ96BN8 352 aa20.63■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXB1Q99853 325 aa20.63■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 SIAH2O43255 324 aa20.62■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 ITGA5P08648 1049 aa20.62■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 C17orf78Q8N4C9 275 aa20.62■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa20.61■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 OR51V1Q9H2C8 321 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 NELFAQ9H3P2 528 aa20.61■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 RERGLQ9H628 205 aa20.61■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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CAPNS1-214ENST00000592483 CDH11P55287 796 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 ARF1P84077 181 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 HSF2Q03933 536 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 APOFQ13790 326 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNMB1Q16558 191 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL12Q53G59 568 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 STEAP2Q8NFT2 490 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 OR1K1Q8NGR3 316 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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