RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582782.5

RPL17-215, Transcript of ribosomal protein L17, human

TSL 3

Gene RPL17, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL17-215	ENST00000582782	SPINK14	Q6IE38	97 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	LCN12	Q6JVE5	192 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ZNF774	Q6NX45	483 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	PEX26	Q7Z412	305 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	CEND1	Q8N111	149 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	PRELID2	Q8N945	189 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	DCUN1D4	Q92564	292 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	TMEM54	Q969K7	222 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	OR51J1	Q9H342	316 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	BEX1	Q9HBH7	125 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	RETN	Q9HD89	108 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	SHPRH	Q149N8	1683 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	RGS12	O14924	1447 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	NPAT	Q14207	1427 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782		A0A0G2JLM5	398 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	BCKDK	O14874	412 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	CHMP2A	O43633	222 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	SUPT7L	O94864	414 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	MB	P02144	154 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	TPM1	P09493	284 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	CHTF8	P0CG12	524 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	SRM	P19623	302 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	DMTN	Q08495	405 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	TWF1	Q12792	350 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	AQP6	Q13520	282 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	CLINT1	Q14677	625 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	SPESP1	Q6UW49	350 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	OR52E5	Q8NH55	327 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	CERS2	Q96G23	380 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	UCK2	Q9BZX2	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	IL22	Q9GZX6	179 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782		A0A0B4J2A0	478 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	TMEM120B	A0PK00	339 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ZNF726	A6NNF4	738 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782		A8MUA0	341 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	FCN3	O75636	299 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	HLA-H	P01893	362 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	IFNW1	P05000	195 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	CSF3	P09919	207 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	ZBTB25	P24278	435 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	SERPINB5	P36952	375 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	AQP2	P41181	271 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	CCR8	P51685	355 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	TRAM2	Q15035	370 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	PSMD5	Q16401	504 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	LINC00523	Q86TU6	105 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RPL17-215	ENST00000582782	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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