RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC9AQ6UXN8 241 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 DAPP1Q9UN19 280 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 NID1P14543 1247 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 CD1CP29017 333 aa19.53■□□□□ 0.72
PTPRM-211ENST00000580170 LIPNQ5VXI9 398 aa19.53■□□□□ 0.72
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PTPRM-211ENST00000580170 LINC01465Q8N7H1 131 aa19.53■□□□□ 0.72
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PTPRM-211ENST00000580170 PRTGQ2VWP7 1150 aa19.52■□□□□ 0.72
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PTPRM-211ENST00000580170 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 OR6K3Q8NGY3 331 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM231Q9H6L2 316 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 RPL34P49207 117 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 EDDM3BP56851 147 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRM-211ENST00000580170 RBPJQ06330 500 aa19.5■□□□□ 0.71
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