RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TUBB1Q9H4B7 451 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 KRBA1A5PL33 1030 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 PRSS44E7EML9 344 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 CAPNS1P04632 268 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 GYPBP06028 91 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 DUSP1P28562 367 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 PMPCAQ10713 525 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 FUT7Q11130 342 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 FAHD1Q6P587 224 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 LILRA2Q8N149 483 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 OPALINQ96PE5 141 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 GPR87Q9BY21 358 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SLC38A1Q9H2H9 487 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 B4GAT1O43505 415 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 FGF17O60258 216 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 PIAS2O75928 621 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 TPPPO94811 219 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 FBXO45P0C2W1 286 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 CISD3P0C7P0 127 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 PNLIPP16233 465 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SPI1P17947 270 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 CLDN15P56746 228 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 RNF4P78317 190 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 GAB1Q13480 694 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF546Q86UE3 836 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SLC51BQ86UW2 128 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 ST7LQ8TDW4 575 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SEH1LQ96EE3 360 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA1456Q9P272 454 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0U1RQS6 177 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 M0R082 166 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 KIR2DS2P43631 304 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 RAB5CP51148 216 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF136P52737 540 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF85Q03923 595 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SLC39A7Q92504 469 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 FGGYQ96C11 551 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 DLL4Q9NR61 685 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 CSF3P09919 207 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SYT9Q86SS6 491 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 PRR18Q8N4B5 295 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 PP6455Q8WZ26 134 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PPC1 479 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SLC22A20A6NK97 555 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 FAM183AA6NL82 134 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 TNFSF15O95150 251 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 HLA-DMAP28067 261 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 FUT6P51993 359 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SPCS2Q15005 226 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SYT14P1Q58G82 188 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 GABRG2P18507 467 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 DYRK1AQ13627 763 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 RAB35Q15286 201 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SLC35E1Q96K37 410 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 CHRDL1Q9BU40 450 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC61Q9BV99 259 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 AIPO00170 330 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 QDPRP09417 244 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 SCGB2A2Q13296 93 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 S1PR3Q99500 378 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 NKX2-2O95096 273 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 TNFRSF1AP19438 455 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 CNR1P21554 472 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 TAS2R45P59539 299 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms