RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	LRRTM2	O43300	516 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	UPK3A	O75631	287 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ARL6IP5	O75915	188 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF432	O94892	652 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	MYL9	P24844	172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	MXD1	Q05195	221 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	TRIL	Q7L0X0	811 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	PHYHIP	Q92561	330 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	TPK1	Q9H3S4	243 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	HMG20A	Q9NP66	347 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	EMC3	Q9P0I2	261 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	MED13	Q9UHV7	2174 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF716	A6NP11	495 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF24	P17028	368 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	SDC2	P34741	201 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	C10orf128	Q5T292	105 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM123	Q8N131	208 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	RNF128	Q8TEB7	428 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	AP3S1	Q92572	193 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	C1orf198	Q9H425	327 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	PRORY	Q9H606	182 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610		A0A075B6Q4	140 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	DHH	O43323	396 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ABHD16A	O95870	558 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	MTNR1B	P49286	362 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	SELENOP	P49908	381 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	SGCA	Q16586	387 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	TPRA1	Q86W33	373 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	TEX19	Q8NA77	164 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	BSN	Q9UPA5	3926 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	PRR32	B1ATL7	298 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF879	B4DU55	563 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ITGB2	P05107	769 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	CPN1	P15169	458 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	CCR9	P51686	369 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	INA	Q16352	499 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	OTP	Q5XKR4	325 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	FDX2	Q6P4F2	183 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	THRSP	Q92748	146 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	TMEM45B	Q96B21	275 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	AMELY	Q99218	206 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	POLE4	Q9NR33	117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	CENPM	Q9NSP4	180 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATG13-222	ENST00000534610	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23

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