RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	TPPP3	Q9BW30	176 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	NIPAL2	Q9H841	368 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		0.92	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	TRIP11	Q15643	1979 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1B0GWJ7	208 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	REM1	O75628	298 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	KLHL2	O95198	593 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF688	P0C7X2	276 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	ME2	P23368	584 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	CD1C	P29017	333 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	PRMT2	P55345	433 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	FBXW4	P57775	412 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	CRADD	P78560	199 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	PPIL2	Q13356	520 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	CLINT1	Q14677	625 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	MPV17L2	Q567V2	206 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760		Q6ZS52	159 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM135	Q86UB9	458 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	METTL13	Q8N6R0	699 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	IP6K3	Q96PC2	410 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	STAC	Q99469	402 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	SH3GL1	Q99961	368 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	C1orf198	Q9H425	327 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	POLE3	Q9NRF9	147 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		0.91	□□□□□ -2.26
CDK1-208	ENST00000519760	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	DPM1	O60762	260 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	CNMD	O75829	334 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	C2	P06681	752 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	GPR89B	P0CG08	455 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	HRES1	P13985	223 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	RAB3B	P20337	219 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	CASP14	P31944	242 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	TGFBR2	P37173	567 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	VHL	P40337	213 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	SYK	P43405	635 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	MXD1	Q05195	221 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	SNX20	Q7Z614	316 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	SLC35G3	Q8N808	338 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	TTL	Q8NG68	377 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	OR2T3	Q8NH03	318 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	PSKH2	Q96QS6	385 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	COPS8	Q99627	209 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	RBBP8	Q99708	897 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	RAB33B	Q9H082	229 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	KIF3A	Q9Y496	699 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		0.9	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	KIF16B	Q96L93	1317 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	CACNA1D	Q01668	2161 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	C3orf84	H3BNL1	204 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760		K7EQM0	130 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760		L7N2F9	121 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	SCGN	O76038	276 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	CD3G	P09693	182 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	OR5H8	P0DN80	308 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	CEACAM3	P40198	252 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	GRIA1	P42261	906 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	EPS15	P42566	896 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	RND2	P52198	227 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	PPP1CB	P62140	327 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	ACTG2	P63267	376 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	IHH	Q14623	411 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF77	Q15935	545 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	DEFB134	Q4QY38	66 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF607	Q96SK3	696 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	CWH43	Q9H720	699 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		0.89	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	THADA	Q6YHU6	1953 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760		K7EPI3	171 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	GOSR2	O14653	212 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	SMPD2	O60906	423 aa		0.88	□□□□□ -2.27
CDK1-208	ENST00000519760	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27

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