RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR6C74A6NCV1 312 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 AQP9O43315 295 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCGB2A1O75556 95 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 AIFM1O95831 613 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSMCR30P0CW71 290 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCNB1P14635 433 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 HTR2AP28223 471 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLRB1Q12918 225 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLINT1Q14677 625 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 GANABQ14697 944 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 YIF1BQ5BJH7 314 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCNJQ5T5M9 372 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFAND6Q6FIF0 208 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRSS54Q6PEW0 395 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBPL2Q6SJ96 375 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 C4orf36Q96KX1 117 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 OMDQ99983 421 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC2A8Q9NY64 477 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPH3ALQ9UNE2 315 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 DOCK6Q96HP0 2047 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM47DPA6NHR8 397 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCA5LO95447 670 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHV2-5P01817 119 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGF1P05230 155 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCNA1P78396 465 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM135Q86UB9 458 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR5T1Q8NG75 326 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRGPRFQ96AM1 343 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
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RNU6-277P-201ENST00000516272 CLDN3O15551 220 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERLIN2O94905 339 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACSM4P0C7M7 580 aa0.39□□□□□ -2.35
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RNU6-277P-201ENST00000516272 NTF3P20783 257 aa0.39□□□□□ -2.35
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RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL38Q2WGJ6 581 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM69Q5SWH9 247 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 AVPI1Q5T686 147 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMPPEQ6ZT21 453 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
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RNU6-277P-201ENST00000516272 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
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RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRN3Q9H3W5 708 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 UFSP2Q9NUQ7 469 aa0.39□□□□□ -2.35
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RNU6-277P-201ENST00000516272 PPIL2Q13356 520 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF141Q15928 474 aa0.38□□□□□ -2.35
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RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL12Q53G59 568 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 SFT2D3Q587I9 215 aa0.38□□□□□ -2.35
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RNU6-277P-201ENST00000516272 CNDP1Q96KN2 507 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDHR2Q9BYE9 1310 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 MDN1Q9NU22 5596 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
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RNU6-277P-201ENST00000516272 CCL21O00585 134 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAMP3O60896 148 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCELO95171 688 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAHP00439 452 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHV3-11P01762 117 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD3GP09693 182 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACOT2P49753 483 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
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