RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ABCB10Q9NRK6 738 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 NEU3Q9UQ49 428 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 KCNE3Q9Y6H6 103 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GTQ1 180 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 M0R3G1 203 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 MGMTP16455 207 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 HOXA9P31269 272 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 HERVK_113P61574 105 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 SPAG1Q07617 926 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-212ENST00000491302 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP18Q8NEJ0 188 aa5.09□□□□□ -1.59
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PTPRC-212ENST00000491302 H0YC42 278 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-212ENST00000491302 GNAO1P09471 354 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-212ENST00000491302 ILKQ13418 452 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 ITIH4Q14624 930 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2UQ5VVX9 321 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-212ENST00000491302 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 SEH1LQ96EE3 360 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 IFI27L2Q9H2X8 130 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-212ENST00000491302 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRC-212ENST00000491302 CECR2Q9BXF3 1484 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 H0YHG0 523 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 TEX46H3BTG2 121 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 FABP3P05413 133 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 CDKN2BP42772 138 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 IFT88Q13099 833 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 NCF4Q15080 339 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 QPRTQ15274 297 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 POU2AF1Q16633 256 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 NUBPLQ8TB37 319 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 MICU1Q9BPX6 476 aa5.07□□□□□ -1.6
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PTPRC-212ENST00000491302 RETNQ9HD89 108 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-HP01893 362 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 ARG1P05089 322 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2MP0CAP2 368 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PSG2P11465 335 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 MAS1LP35410 378 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 CEACAM6P40199 344 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 RAD51Q06609 339 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF726P1Q15940 193 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN20Q4JDL3 420 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 HES5Q5TA89 166 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PCP2Q8IVA1 136 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 OPALINQ96PE5 141 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 AIREO43918 545 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 OR5H8P0DN80 308 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-212ENST00000491302 MNAT1P51948 309 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-212ENST00000491302 GINS1Q14691 196 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-212ENST00000491302 OR52W1Q6IF63 320 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 GPX8Q8TED1 209 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM230Q96A57 120 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF799Q96GE5 643 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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