RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HRGP04196 525 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COX6A1P12074 109 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERP29P30040 261 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MNDAP41218 407 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF20Q5VT98 475 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4K17Q8NGC6 315 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LILRB4Q8NHJ6 448 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB5Q8WWX0 329 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF700Q9H0M5 742 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GHITMQ9H3K2 345 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RCE1Q9Y256 329 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EML6Q6ZMW3 1958 aa16.72■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A6NL46 340 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GZMKP49863 264 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLA2G7Q13093 441 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q5BKY6 102 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFAND1Q8TCF1 268 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FCAMRQ8WWV6 532 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EMC9Q9Y3B6 208 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DMDP11532 3685 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PNR3 127 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ECDO95905 644 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1QBP02746 253 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGA5P08648 1049 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 P2RY4P51582 365 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAS2R20P59543 309 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAPQ12884 760 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNTA1Q13424 505 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXT1Q16394 746 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM225Q6GV28 225 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UEVLDQ8IX04 471 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5B2Q96R09 309 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTGES2Q9H7Z7 377 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLK11Q9UBX7 282 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa16.71■□□□□ 0.27
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTLL8A6PVC2 850 aa16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD2P06729 351 aa16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTHLHP12272 177 aa16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAB21L1Q13394 359 aa16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CORO6Q6QEF8 472 aa16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BTN2A1Q7KYR7 527 aa16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR51D1Q8NGF3 324 aa16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C15orf40Q8WUR7 153 aa16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBP7Q96R05 134 aa16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 G6PC2Q9NQR9 355 aa16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUC3AQ02505 3323 aa16.7■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYPP08247 313 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF1P41567 113 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAG2P55895 527 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP3S2P59780 193 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEGS2Q6QHC5 323 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2Y1Q8NGV0 311 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C11orf40Q8WZ69 217 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED28Q9H204 178 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HRASLSQ9HDD0 168 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52A1Q9UKL2 312 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PQ72 361 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACOT7O00154 380 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC17A2O00624 439 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GMDSO60547 372 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPPPO94811 219 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLSO94925 669 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H2AFB2P0C5Z0 115 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FSTP19883 344 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADH6P28332 368 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNK1Q13470 666 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRFN4Q6PJG9 635 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OPN5Q6U736 354 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF133Q8WVZ7 376 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CKLFQ9UBR5 152 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PISDQ9UG56 409 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HHLA2Q9UM44 414 aa16.69■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF814B7Z6K7 855 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XRCC3O43542 346 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ISG15P05161 165 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDHBP21912 280 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SFTPDP35247 375 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POU3F4P49335 361 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FCN2Q15485 313 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB11BQ15907 218 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THEM4Q5T1C6 240 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM166AQ6J272 317 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM81Q6P7N7 255 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPAT4Q86UL3 456 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLCZ1Q86YW0 608 aa16.68■□□□□ 0.26
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLPP7Q8NBV4 271 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms