RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR82Q6UXN9 313 aa6.15□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF75AQ96N20 296 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GPA33Q99795 319 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MS4A8Q9BY19 250 aa6.15□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 DHRS12A0PJE2 317 aa6.14□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF480Q8WV37 535 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB8BQ92930 207 aa6.14□□□□□ -1.43
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RABGEF1-202ENST00000380828 RSG1Q9BU20 258 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 ASPNQ9BXN1 380 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 CHIAQ9BZP6 476 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1-202ENST00000380828 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.14□□□□□ -1.43
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