RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 LHX2P50458 406 aa17.02■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa17.02■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 CDC20Q12834 499 aa17.02■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 TMEM123Q8N131 208 aa17.02■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 C4orf45Q96LM5 186 aa17.02■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 WDFY2Q96P53 400 aa17.02■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 COMMD4Q9H0A8 199 aa17.02■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SLC6A15Q9H2J7 730 aa17.02■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 A0A1B0GVG6 124 aa17.01■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 TMEM212A6NML5 194 aa17.01■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ZNF716A6NP11 495 aa17.01■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SELENOPP49908 381 aa17.01■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 TNFSF10P50591 281 aa17.01■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 WDR38Q5JTN6 314 aa17.01■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 DDI2Q5TDH0 399 aa17.01■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ZNF676Q8N7Q3 588 aa17.01■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 TMEM178AQ8NBL3 297 aa17.01■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ZNF254O75437 659 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 PNPP00491 289 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 CCR9P51686 369 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 DEFB109BQ30KR1 87 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 HSD17B12Q53GQ0 312 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 PHYHD1Q5SRE7 291 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 DEGS2Q6QHC5 323 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SLC22A16Q86VW1 577 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SNX29P2Q8IUI4 249 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 MIXL1Q9H2W2 232 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 EMC7Q9NPA0 242 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 NOX4Q9NPH5 578 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 COMMD3Q9UBI1 195 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 LOC400499M0QZD8 3231 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ACOD1A6NK06 481 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 MAGEB1P43366 347 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 KIR3DL2P43630 455 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 CLDN18P56856 261 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 OR10A3P58181 314 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SRYQ05066 204 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 KCNMB1Q16558 191 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 RNF133Q8WVZ7 376 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 PNPLA2Q96AD5 504 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 C1orf198Q9H425 327 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa17■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 PIN1P1O15428 100 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 OCM2P0CE71 109 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SRMP19623 302 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 RAB3BP20337 219 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 IFITM3Q01628 133 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SLC10A1Q14973 349 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ODF4Q2M2E3 257 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 Q499Y3 187 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 C10orf128Q5T292 105 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 IDNKQ5T6J7 187 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 FCRLAQ7L513 359 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 RDH10Q8IZV5 341 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SLAMF6Q96DU3 332 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 DERL3Q96Q80 235 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ACKR4Q9NPB9 350 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 POLE4Q9NR33 117 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 CENPMQ9NSP4 180 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 FBXL3Q9UKT7 428 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 CSAG2Q9Y5P2 127 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 LHFPL6Q9Y693 200 aa16.99■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 CYTIPO60759 359 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 H2BFMP0C1H6 154 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ZNF708P17019 499 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 NHLH1Q02575 133 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ZNF544Q6NX49 715 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SFXN4Q6P4A7 337 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 MZT2AQ6P582 158 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 C20orf196Q8IYI0 205 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 FAM109AQ8N4B1 249 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ACOT12Q8WYK0 555 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 HTRA1Q92743 480 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 RCE1Q9Y256 329 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 A0A0G2JK05 382 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 ITGB2P05107 769 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 NTF4P34130 210 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 PPP3R1P63098 170 aa16.98■□□□□ 0.31
UPP1-201ENST00000331803 SYT9Q86SS6 491 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms