RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa21.95■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 RASD2Q96D21 266 aa21.95■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 DOK1Q99704 481 aa21.95■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 C19orf24Q9BVV8 132 aa21.95■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa21.95■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 H7C1C5 153 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SCG5P05408 212 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 CTLA4P16410 223 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 ZNF23P17027 643 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 GLRXP35754 106 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 LCN6P62502 163 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 GK3PQ14409 553 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 IL17RELQ6ZVW7 336 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 LRRC18Q8N456 261 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 FANK1Q8TC84 345 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SNX18Q96RF0 628 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 WACQ9BTA9 647 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 BPESC1Q9GZL8 116 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 POLE4Q9NR33 117 aa21.94■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 XKRYO14609 159 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 GSC2O15499 205 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 ZNF32P17041 273 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 EVX1P49640 407 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 RPS6KA3P51812 740 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SYT9Q86SS6 491 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 ZNF540Q8NDQ6 660 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SLC30A7Q8NEW0 376 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 OR9Q2Q8NGE9 314 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 CANT1Q8WVQ1 401 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 IL20Q9NYY1 176 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SLC7A8Q9UHI5 535 aa21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 PTHP01270 115 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 MSR1P21757 451 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 LAP3P28838 519 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SLC6A6P31641 620 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 PSG4Q00888 419 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 CARTPTQ16568 116 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SGCAQ16586 387 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 KRT80Q6KB66 452 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 LRGUKQ96M69 825 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SOX7Q9BT81 388 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 CHID1Q9BWS9 393 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 DGCR6LQ9BY27 220 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SYT4Q9H2B2 425 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 POMPQ9Y244 141 aa21.92■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 IDH3BO43837 385 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 ICMTO60725 284 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 PPP1R3DO95685 299 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 GASTP01350 101 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 HNF1AP20823 631 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 GIFP27352 417 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 KCNMB1Q16558 191 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 MICAQ29983 383 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 POM121L2Q96KW2 1035 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SAMD8Q96LT4 415 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 DDOQ99489 341 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 WNT5BQ9H1J7 359 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 RNF121Q9H920 327 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SPEF1Q9Y4P9 236 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 CDH10Q9Y6N8 788 aa21.91■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 DHRS12A0PJE2 317 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SOCS2O14508 198 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 CCNB2O95067 398 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 VHLLQ6RSH7 139 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 CD300LDQ6UXZ3 194 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 ZNF416Q9BWM5 594 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 OR2H1Q9GZK4 316 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 NUAK2Q9H093 628 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 RAB1BQ9H0U4 201 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 KCNN2Q9H2S1 579 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 CMAHPQ9Y471 501 aa21.9■■□□□ 1.1
RP9-201ENST00000297157 LOC100509620A0A075B734 347 aa21.89■■□□□ 1.09
RP9-201ENST00000297157 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa21.89■■□□□ 1.09
RP9-201ENST00000297157 ARRDC5A6NEK1 342 aa21.89■■□□□ 1.09
RP9-201ENST00000297157 VSTM5A8MXK1 200 aa21.89■■□□□ 1.09
RP9-201ENST00000297157 DCTN6O00399 190 aa21.89■■□□□ 1.09
RP9-201ENST00000297157 BHLHE40O14503 412 aa21.89■■□□□ 1.09
RP9-201ENST00000297157 STAMBPO95630 424 aa21.89■■□□□ 1.09
RP9-201ENST00000297157 TGFAP01135 160 aa21.89■■□□□ 1.09
RP9-201ENST00000297157 TACSTD2P09758 323 aa21.89■■□□□ 1.09
RP9-201ENST00000297157 PLP2Q04941 152 aa21.89■■□□□ 1.09
RP9-201ENST00000297157 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms