RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 MRGPRX4Q96LA9 322 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 OR2A14Q96R47 310 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-201ENST00000220888 GASTP01350 101 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TACR1P25103 407 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 BTF3L4Q96K17 158 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 C3orf30Q96M34 536 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 Q96M85 177 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 IKZF5Q9H5V7 419 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF266Q14584 549 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF546Q86UE3 836 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OR1J1Q8NGS3 322 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ROBO4Q8WZ75 1007 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 JAM3Q9BX67 310 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 RAB1BQ9H0U4 201 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 IFT172Q9UG01 1749 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OR7A17O14581 309 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TNFSF14O43557 240 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ACHEP22303 614 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TESK1Q15569 626 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 EBF1Q9UH73 591 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 DFFBO76075 338 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MYF5P13349 255 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 FPR3P25089 353 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 HYAL1Q12794 435 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 HES3Q5TGS1 186 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SUMF1Q8NBK3 374 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 P4HTMQ9NXG6 502 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LTN1O94822 1766 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CHRM2P08172 466 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 NID1P14543 1247 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ACKR3P25106 362 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 UBE2KP61086 200 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 NFATC3Q12968 1075 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 DUSP5Q16690 384 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SHISA4Q96DD7 197 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OPALINQ96PE5 141 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CD300AQ9UGN4 299 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ICOSLGO75144 302 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PMP2P02689 132 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SMIM17P0DL12 118 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 FOLR1P15328 257 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TAS2R45P59539 299 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SEH1LQ96EE3 360 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 OR11A1Q9GZK7 315 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LILRA5A6NI73 299 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 NRASP01111 189 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PSMB3P49720 205 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 BPIFB3P59826 476 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PMPCAQ10713 525 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF385BQ569K4 471 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 BEX5Q5H9J7 111 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 FBXL6Q8N531 539 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 FAM3DQ96BQ1 224 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 PLK3Q9H4B4 646 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 MYO10Q9HD67 2058 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 WDR1O75083 606 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 BTG2P78543 158 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF628Q5EBL2 1059 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM65Q6PI78 240 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-201ENST00000220888 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.63□□□□□ -0.87
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