RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cramp1Q6PG95 1285 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r208Q8R275 308 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Serinc1Q9QZI8 453 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Taf1Q80UV9 1891 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kiaa1324A2AFS3 1009 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bcat2O35855 393 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hsd3b2P26149 373 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp429Q7M6Y0 485 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 RinlQ80UW3 563 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SmoxQ99K82 555 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nudt21Q9CQF3 227 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Aloxe3Q9WV07 711 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cav2Q9WVC3 162 aa15.54■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trav1A0A075B5Z4 110 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Esp15A8R0U8 85 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm45062E0CZ38 131 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 OpcmlG5E8G3 345 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 HpnO35453 436 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 EdaO54693 391 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cox4i1P19783 169 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ApodP51910 189 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tcf7Q00417 419 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 CluQ06890 448 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cmpk2Q3U5Q7 447 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tsr3Q5HZH2 323 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr3Q60879 313 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PcnpQ6P8I4 178 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem221Q8K071 230 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc35a3Q8R1T4 326 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r220Q8R272 298 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr229Q8VFN5 307 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Letmd1Q924L1 360 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ifitm3Q9CQW9 137 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gpr37Q9QY42 600 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Znf106O88466 1888 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rpl7a-ps5A0A140T8L3 268 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 A0A1Y7VIT9 351 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm15821A6X8J8 139 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem229aB9EJI9 371 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r30K7N5W1 852 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r47K7N709 852 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Eef1a1P10126 462 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Prss34Q80UR4 318 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dtx3Q80V91 347 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Emc1Q8C7X2 997 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 C1rbQ8CFG9 706 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1099Q8VG37 312 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lnx2Q91XL2 687 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pink1Q99MQ3 580 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kcnj10Q9JM63 379 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arid1aA2BH40 2283 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Znf296E9Q6W4 445 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hoxc11P31313 304 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm6760Q0ZNK3 87 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Esp1Q3LHH8 102 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc26a11Q80ZD3 593 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ska3Q8C263 411 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Iglon5Q8HW98 336 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr769Q8K501 312 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr131Q8VGC8 314 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc25a37Q920G8 338 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ppil1Q9D0W5 166 aa15.53■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm21731A0A286YDE9 180 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr370E9Q848 314 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01664 111 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ercc1P07903 298 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NcanP55066 1268 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr201Q7TS38 308 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Q8C4P0 716 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr935Q8VG16 308 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 HrgQ9ESB3 525 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Arpc3Q9JM76 178 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ankdd1aA0A1L1ST07 508 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sirt6P59941 334 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Anxa7Q07076 463 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Xkr7Q5GH64 580 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Kcnc3Q63959 769 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fam57bQ7TNV1 275 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zer1Q80ZJ6 779 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tspan12Q8BKT6 305 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PigtQ8BXQ2 582 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ccdc58Q8R3Q6 144 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cbx7Q8VDS3 158 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PsenenQ9CQR7 101 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Trappc6bQ9D289 158 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrrc51Q9DAK8 192 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ceacam13Q9DAT7 263 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Bbs10Q9DBI2 713 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r40Q9EQ46 310 aa15.52■□□□□ 0.08
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ttll3A4Q9E5 927 aa15.52■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm20683H3BKJ1 410 aa15.52■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn1r94K7N6X3 305 aa15.52■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 EhfO70273 300 aa15.52■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cops3O88543 423 aa15.52■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01648 108 aa15.52■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NfyaP23708 346 aa15.52■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 FapP97321 761 aa15.52■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Opn5Q6VZZ7 377 aa15.52■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gprin3Q8BWS5 763 aa15.52■□□□□ 0.07
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr633Q8VF02 312 aa15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.4 ms