RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 MTERF3Q96E29 417 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ARL5BQ96KC2 179 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 C20orf173Q96LM9 149 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ZNF75AQ96N20 296 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CITED1Q99966 193 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 EBPLQ9BY08 206 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 MMP27Q9H306 513 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 TOR3AQ9H497 397 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.15□□□□□ -1.42
SENP3-210ENST00000619785 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
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SENP3-210ENST00000619785 A0A0X1KG70 313 aa6.14□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 ANKRD28O15084 1053 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 ZNF208O43345 1280 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 SYNGR3O43761 229 aa6.14□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 ANPEPP15144 967 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 CBR1P16152 277 aa6.14□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 P2RY4P51582 365 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 MYBPC1Q00872 1141 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 LCP2Q13094 533 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 CARTPTQ16568 116 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 DCST2Q5T1A1 773 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 CCNJQ5T5M9 372 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 SAXO2Q658L1 398 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.14□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 LCA5Q86VQ0 697 aa6.14□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 EGLN2Q96KS0 407 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 ERP44Q9BS26 406 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.14□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 SNX24Q9Y343 169 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.14□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.13□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.13□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 HSPB6O14558 160 aa6.13□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 BCL10O95999 233 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 LYNX1P0DP58 116 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 TSPAN8P19075 237 aa6.13□□□□□ -1.43
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SENP3-210ENST00000619785 IL1RL1Q01638 556 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 CAV1Q03135 178 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 HSPB3Q12988 150 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 CASP12Q6UXS9 341 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 ZNF627Q7L945 461 aa6.13□□□□□ -1.43
SENP3-210ENST00000619785 LINGO2Q7L985 606 aa6.13□□□□□ -1.43
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