RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	B9D1	Q9UPM9	204 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	COL6A3	P12111	3177 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PER3	P56645	1201 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CAMK2D	Q13557	499 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	OTOS	Q8NHW6	89 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MIB2	Q96AX9	1013 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PPA2	Q9H2U2	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	FGF21	Q9NSA1	209 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PRSS37	A4D1T9	235 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	FITM1	A5D6W6	292 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	STMND1	H3BQB6	276 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CTDSPL	O15194	276 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	HRG	P04196	525 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CD1A	P06126	327 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CSF2RB	P32927	897 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	AP3S2	P59780	193 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	FMOD	Q06828	376 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	C4orf45	Q96LM5	186 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CA10	Q9NS85	328 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ITGA5	P08648	1049 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SLC6A8	P48029	635 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	POU3F4	P49335	361 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TSPAN5	P62079	268 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	LIPH	Q8WWY8	451 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM131	Q92545	1883 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341		H3BML4	177 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SIX6	O95475	246 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TXNDC12	O95881	172 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	FBXW4	P57775	412 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TEX261	Q6UWH6	196 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ARL5B	Q96KC2	179 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341		U3KQ87	197 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM212	A6NML5	194 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ALG1L2	C9J202	215 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ACOT7	O00154	380 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TSPAN2	O60636	221 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SRF	P11831	508 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	BCKDHB	P21953	392 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	COMMD7	Q86VX2	200 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	RBBP9	O75884	186 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PIAS2	O75928	621 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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