RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 SPAG4Q9NPE6 437 aa10.3□□□□□ -0.76
CTIF-208ENST00000590422 ABCD2Q9UBJ2 740 aa10.3□□□□□ -0.76
CTIF-208ENST00000590422 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.3□□□□□ -0.76
CTIF-208ENST00000590422 WIPI2Q9Y4P8 454 aa10.3□□□□□ -0.76
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CTIF-208ENST00000590422 MCIDASD6RGH6 385 aa10.29□□□□□ -0.76
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CTIF-208ENST00000590422 SLC30A8Q8IWU4 369 aa10.29□□□□□ -0.76
CTIF-208ENST00000590422 CLDN22Q8N7P3 220 aa10.29□□□□□ -0.76
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CTIF-208ENST00000590422 AKR7LQ8NHP1 331 aa10.28□□□□□ -0.76
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CTIF-208ENST00000590422 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CTIF-208ENST00000590422 SAP30LQ9HAJ7 183 aa10.28□□□□□ -0.76
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CTIF-208ENST00000590422 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CTIF-208ENST00000590422 CD300AQ9UGN4 299 aa10.28□□□□□ -0.76
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CTIF-208ENST00000590422 C5orf49A4QMS7 147 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-208ENST00000590422 CENPBD1B2RD01 187 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-208ENST00000590422 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CTIF-208ENST00000590422 SPRY3O43610 288 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-208ENST00000590422 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTIF-208ENST00000590422 PTHP01270 115 aa10.27□□□□□ -0.77
CTIF-208ENST00000590422 IGF2P01344 180 aa10.27□□□□□ -0.77
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