RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 ZADH2Q8N4Q0 377 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 YIPF7Q8N8F6 280 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD4Q8TB40 342 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 GHSRQ92847 366 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD6Q9BV23 337 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 HDHD5Q9BXW7 423 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNN2Q9H2S1 579 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MMP27Q9H306 513 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 LIPGQ9Y5X9 500 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 TMCC2O75069 709 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SERPINA3P01011 423 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGB2P05107 769 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 INHBBP09529 407 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS19P39019 145 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMB10P40306 273 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 PEX19P40855 299 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS27P42677 84 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 GDI2P50395 445 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 DEGS2Q6QHC5 323 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX19Q8NA77 164 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10H5Q8NGA6 315 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 OR52N5Q8NH56 324 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ST7LQ8TDW4 575 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB127Q9H1M4 99 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF122Q9H9V4 155 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF254O75437 659 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNGR4O95473 234 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF404Q494X3 552 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 PHYHD1Q5SRE7 291 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF128Q8TEB7 428 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP6Q96JE9 813 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ELOVL3Q9HB03 270 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 GALNT8Q9NY28 637 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 IKZF2Q9UKS7 526 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A075B6Q4 140 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GVC2 190 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PPL8 197 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMD9O00233 223 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC43A1O75387 559 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SOX6P35712 828 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SELENOPP49908 381 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 PAMR1Q6UXH9 720 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MCFD2Q8NI22 146 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 PHYHIPQ92561 330 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 WDYHV1Q96HA8 205 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 LDAHQ9H6V9 325 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 POLE4Q9NR33 117 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SPRR3Q9UBC9 169 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CD8B2A6NJW9 211 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR171O14626 319 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 DHHO43323 396 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 GATBO75879 557 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CDRT1O95170 752 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CD8BP10966 210 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 NTF4P34130 210 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MTNR1BP49286 362 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 RORCP51449 518 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 CCR9P51686 369 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 LSM6P62312 80 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SRYQ05066 204 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 OTPQ5XKR4 325 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 RHOUQ7L0Q8 258 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 AAED1Q7RTV5 226 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF133Q8WVZ7 376 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A46Q96AG3 418 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 MROQ9BYG7 248 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF281Q9Y2X9 895 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF724A8MTY0 619 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF24P17028 368 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 SDC2P34741 201 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 PMP22Q01453 160 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 ACSM3Q53FZ2 586 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 YIF1BQ5BJH7 314 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRN1Q6UXK5 716 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZS92 163 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-207ENST00000589146 DCXRQ7Z4W1 244 aa20.15■□□□□ 0.82
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