RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 KCTD21Q4G0X4 260 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 FAM27BQ5VT28 67 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SLC16A9Q7RTY1 509 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 FJX1Q86VR8 437 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 PRR7Q8TB68 274 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ASB5Q8WWX0 329 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 C11orf40Q8WZ69 217 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SEC61A2Q9H9S3 476 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SIAEQ9HAT2 523 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 TAS2R16Q9NYV7 291 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CACNA1CQ13936 2221 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 TVP23AA6NH52 213 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 LRRTM2O43300 516 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 MPZL1O95297 269 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 TNFAIP8O95379 198 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 FADS2O95864 444 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 HLA-DQA2P01906 255 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SCG5P05408 212 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF823P16415 610 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 MSR1P21757 451 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 BMP5P22003 454 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 IGHV1-2P23083 117 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CDAP32320 146 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ADORA2A-AS1P86434 159 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 LYPD4Q6UWN0 246 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 LIX1LQ8IVB5 337 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 OR51G2Q8NGK0 314 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 MYDGFQ969H8 173 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 FOXN4Q96NZ1 517 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 INTS14Q96SY0 518 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 MNTQ99583 582 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 WACQ9BTA9 647 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 JAM3Q9BX67 310 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 PTGES3LE9PB15 166 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 DCKP27707 260 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CHRNB4P30926 498 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ATP6V1E1P36543 226 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ENTPD1P49961 510 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 TGFBR3Q03167 851 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ST3GAL4Q11206 333 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SGCAQ16586 387 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ANKRD16Q6P6B7 361 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SHFQ7M4L6 423 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SLC22A24Q8N4F4 322 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 OR10H5Q8NGA6 315 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 OR4F15Q8NGB8 312 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 OR52I1Q8NGK6 324 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 OR1K1Q8NGR3 316 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC120Q96HB5 630 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM80Q96HE8 168 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SIGLEC11Q96RL6 698 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 RHNO1Q9BSD3 238 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 COPS4Q9BT78 406 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF696Q9H7X3 374 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 WDR76Q9H967 626 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 COQ3Q9NZJ6 369 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CLEC18AA5D8T8 446 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SELENOFO60613 162 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 IGHA1P01876 353 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CDK1P06493 297 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CST2P09228 141 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 OR2T7P0C7T2 308 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 OR8G3PP0DMU2 310 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ADAM8P78325 824 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 MEP1BQ16820 701 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 RNLSQ5VYX0 342 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CLEC18BQ6UXF7 455 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF813Q6ZN06 617 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 AHSA2Q719I0 299 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 SYT9Q86SS6 491 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CDC20BQ86Y33 519 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 OR2T27Q8NH04 317 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 LILRB4Q8NHJ6 448 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 INPP5EQ9NRR6 644 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 ELOVL5Q9NYP7 299 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 TMCC2O75069 709 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 FARS2O95363 451 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 RAB36O95755 333 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-210ENST00000568388 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms