RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	PPP1R3D	O95685	299 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	REN	P00797	406 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	CST2	P09228	141 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	NOS3	P29474	1203 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	PLP2	Q04941	152 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	FMOD	Q06828	376 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	NSMAF	Q92636	917 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	NABP1	Q96AH0	204 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	RASD2	Q96D21	266 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	SAMD8	Q96LT4	415 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	FEV	Q99581	238 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	IFT27	Q9BW83	186 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	MOK	Q9UQ07	419 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	10.69	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	BHLHE40	O14503	412 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	SOCS2	O14508	198 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	BMP4	P12644	408 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF35	P13682	527 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	MSR1	P21757	451 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	LAP3	P28838	519 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	TTK	P33981	857 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	GIPR	P48546	466 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	FABP6	P51161	128 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	PIGF	Q07326	219 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	NPRL3	Q12980	569 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	BIVM	Q86UB2	503 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	LNX2	Q8N448	690 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	SH3GL3	Q99963	347 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	BDH2	Q9BUT1	245 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	SYT4	Q9H2B2	425 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	RNF121	Q9H920	327 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	POLE4	Q9NR33	117 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	AP4S1	Q9Y587	144 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	FKBP7	Q9Y680	259 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	SLC16A7	O60669	478 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	SNAP29	O95721	258 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	LY6G6D	O95868	133 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	IGHV4-39	P01824	125 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	CTLA4	P16410	223 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	FAS	P25445	335 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	CDA	P32320	146 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ACTR3	P61158	418 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	TNK1	Q13470	666 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	CCNI	Q14094	377 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ATP6AP1	Q15904	470 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	KCNMB1	Q16558	191 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	SGCA	Q16586	387 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	MUC15	Q8N387	334 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	OR2T33	Q8NG76	320 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	CA10	Q9NS85	328 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	ZAN	Q9Y493	2812 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PPL8	197 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549		H7C1C5	153 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM23-231	ENST00000557549	TIPRL	O75663	272 aa		10.66	□□□□□ -0.7

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