RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF75AQ96N20 296 aa16.69■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FOXB1Q99853 325 aa16.69■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TPK1Q9H3S4 243 aa16.69■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HIF3AQ9Y2N7 669 aa16.69■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LYNX1G3V0Z9 82 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 M0R233 179 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EBAG9O00559 213 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LYNX1P0DP58 116 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACADSP16219 412 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HMGA2P52926 109 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPPA2Q7Z7J5 298 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRG5Q8IZF4 528 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOXO1Q8NFA2 376 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FNDC8Q8TC99 324 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASB10Q8WXI3 467 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF347Q96SE7 839 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEPHS2Q99611 448 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TXNIPQ9H3M7 391 aa16.68■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A6NIZ1 184 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 B4DSR2 109 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBL3O95164 117 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB36O95755 333 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 QDPRP09417 244 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGA4P0DJD7 388 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGA3P0DJD8 388 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 B4GALT1P15291 398 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL4P36578 427 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LIMS1P48059 325 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAP1BP61224 184 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB1AP62820 205 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAP1AP62834 184 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FHL1Q13642 323 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FLOT2Q14254 428 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEC23BQ15437 767 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MSMPQ1L6U9 139 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ELFN2Q5R3F8 820 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TBPL2Q6SJ96 375 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC121Q6ZUS5 278 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR51A7Q8NH64 312 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MOSPD2Q8NHP6 518 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRGUKQ96M69 825 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM15Q9C019 465 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AURKCQ9UQB9 309 aa16.67■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHHO43323 396 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MGRN1O60291 552 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR8G3PP0DMU2 310 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAKP20794 623 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFNGR2P38484 337 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR4P46093 362 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CTXN1P60606 82 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPS23P62266 143 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GALK2Q01415 458 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPIBQ01892 262 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD47Q08722 323 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCNIQ14094 377 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LAPTM4AQ15012 233 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RDH5Q92781 318 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNN2Q9H2S1 579 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 METRNQ9UJH8 293 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.66■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV27A0A087WT01 109 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRMUO75648 421 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GADD45GO95257 159 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAP2AP10114 183 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACHEP22303 614 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL8A2P25067 703 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GIPRP48546 466 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM33P57088 247 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL27P61353 136 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NRN1LQ496H8 165 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBED5Q49AG3 693 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLCCI1Q86VQ1 547 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDFY1Q8IWB7 410 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYT14Q8NB59 555 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR13C2Q8NGS9 318 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBP7Q96R05 134 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYT3Q9BQG1 590 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ALG12Q9BV10 488 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF224Q9NZL3 707 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa16.65■□□□□ 0.26
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0A6YYJ9 748 aa16.64■□□□□ 0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DHRS12A0PJE2 317 aa16.64■□□□□ 0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XKRYO14609 159 aa16.64■□□□□ 0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC42EP2O14613 210 aa16.64■□□□□ 0.25
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGHMP01871 453 aa16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.9 ms